欢迎光临散文网 会员登陆 & 注册

R可视化——Mantel test分析及可视化

2022-07-21 08:25 作者:科研那点事儿  | 我要投稿

此前我们已经讲过了如何使用R语言计算两列数据相关性的分析方法,今天,我们来看一种检验两个矩阵相关关系的方法——Mantel test方法,这种分析方法可用在植物微生物群落与生态环境之间相关性的检验以及人体肠道微生物群落与人体疾病相关性检验等领域。话不多说,直接迈入正文!

加载包

1)设置工作目录

2)安装、加载R包

加载数据

图片
图片


环境因子的相关性分析及展示

图片


Mantel test分析

1)计算OTU与环境因子之间的mantel test的r值和p值


2)定义标签

图片


绘图

图片

参考:

1)https://zhuanlan.zhihu.com/p/507384776

2)https://zhuanlan.zhihu.com/p/110501058


源码及作图数据可在公众号后台回复“mantel test”获取!!!

本文使用 文章同步助手 同步



R可视化——Mantel test分析及可视化的评论 (共 条)

分享到微博请遵守国家法律