[BioLadder云平台] 你想要的韦恩图可以这样画!
大家好!我是BioLadder生物信息在线可视化云平台的工程师小宇,今天我来给大家分享怎样用BioLadder画出常用的韦恩图!
如果您反馈问题,报告Bug,提出新的需求,请直接在公众号内发留言给我哦!为感谢您对BioLadder的认可我们还有星爸爸同款收纳包相赠哦!小宇先谢谢大家喽!


1.什么是韦恩图?
维恩图:也叫文氏图,用于显示元素集合重叠区域的图示。维恩图既可以表示一个独立的集合,也可以表示集合与集合之间的相互关系。 一般个数在2到7组之间。

2.绘图前的数据准备
demo数据可以在
https://www.bioladder.cn/shiny/zyp/bioladder2/demoData/Venn/Venn.rar下载。
该模块支持2种数据格式,下面是详细介绍
2.1 韦恩图常用数据格式
第一行为组名,必须要有,会出现在图中。每一列都是一个分组。

2.2 定量矩阵表格式
每行是一个基因,每列是个样本。行名和列名都要有,数值是定量值。

3.BioLadder生信云平台在线绘制韦恩图
不想写代码?可以用BioLadder生信云平台在线绘制韦恩图。
免费使用,登录后畅享50+模块
网址:https://www.bioladder.cn/web/#/chart/17

3.1 导入数据
3.1.1 上传文件
选择输入文件的类型,是常规格式还是定量矩阵表
点击“选择”按钮上传自己的文件,支持txt,csv,xlsx,xls四种格式

3.1.2 手动输入数据
在输入框内输入您的数据。上方小面板输入分组名称,下方大面板对应分组里的具体内容。

3.2 调整参数
根据需求调整参数即可
• 颜色透明度:调整图案颜色的透明度
• 数字大小:调整图中数字标签的字体大小
• 组名字体大小: 调整图中组名字体的大小
• 是否自定义颜色:勾选后可在下方的颜色选择器中挑选自己喜欢的颜色

3.3 提交查看
上传完数据,并调好参数后,点击右上方“提交”按钮,图像会出现在左侧。如果没有上传自己的数据,会使用默认的demo数据绘图。

3.4 下载
首先,挑选自己想要的格式有png,jpg和pdf供选择,接着调整图片的宽,高和分辨率(注:这里的宽高比会反馈到左上的绘图区),最后点击“Download”下载按钮。

4. 韦恩图结果解读

如图,有三个数据集。图案交叉的地方的数值表示数据集数据相交的个数。图案未交叉的地方的数值表示数据集数据特有的个数。
5.BioLadder云平台
网址:https://www.bioladder.cn/
BioLadder目前上线了生物学分析最常用的50多个模块,主要包括以下四类:
数据可视化:箱线图,南丁格尔玫瑰图,韦恩图,UpSet图,饼图,词云图,核密度图,小提琴图,弦图,柱形图等
组学数据分析:序列的多重比对,表达数据的CV曲线图,PCA,T-SNE,热图,相关性热图等,趋势分析的mFuzz,差异分析的火山图,富集分析的气泡图,修饰位点上下游模体分析的seqLogo,Motif热图等
功能分析:GO弦图,相互作用网络图,富集分析
数据预处理:归一化,补值,FDR校正,长宽表互换等
好了韦恩图的绘制就到这里了,后续大家想要了解什么内容可以给我们评论反馈,我们会根据大家的意见持续更新。我们欢迎您以任何方式提出您的优化意见,使BioLadder平台成为广大科研工作者的生物信息分析首选平台!

青莲百奥可提供一站式蛋白质组学、代谢组学、转录组学、多组学联合分析等科研服务。青莲百奥在整体实验设计方面经验丰富,界内最全的Bioactive Database、NeuroPedia Database,专业分析软件Peaks,海归坐镇生信分析团队,助您在科研道路上乘风破浪,冲击高水平文章。
更多技术服务敬请来电咨询
010-5339583959