智能计算生物大科学问题
我在“海量基因组与智能生物计算”视频中简述了多序列比对能够用来寻找未知生物大分子相互作用的原理,因此在有足够基因组数据时一定可以构建对应的基因组功能单元相互作用网络。这个方向仍在萌芽中,据我所知就我自己在吵吵,希望未来会有越来越多的人加入。
一旦有能力解读任一物种的基因组功能单元相互作用网络,物种分类将不再尴尬,合成生物学设计将成为小朋友的积木游戏。物种相互作用(尤其是我们感兴趣的病原体-宿主)将变成动态网络相互作用分析,这将会是又一个激动人心新研究领域,集图/网络分析与物理过程描述为一体。
这些在基因组功能单元网络层次的新理解和未来分子水平操控的新技术结合将会诞生很多新的研究领域和模式,以前几年甚至几十年发现一个新分子新功能激动不已的情景将会是珍贵的记忆。发展新算法新技术才是真正的研究,买仪器买软件重复写报告的无趣模式很快将被终结。
需要思考也特别有趣的问题是海量基因组多序列比对除了发现基因组编码的生物大分子相互作用还可以拿来做什么?有没有可能跳过多序列比对直接构建智能算法提取海量基因组中亿万年进化的珍贵记录?
年轻的朋友们,在海量基因组中读懂自然和进化将是生物大航海时代,是发现的沃土,是乐趣的海洋。别再卑微地匍匐在sci论文前面焦虑了!