天然产物研究最新成果-202304

首发于公众号【文海拾粹】;作者:文海拾粹
“天然产物研究最新成果”是【文海拾粹-公众号】特色专栏,每月第一个工作日推送(将我们设为星标🌟,及时接收最新资讯),汇总发表于权威期刊(JACS、Angew、OL、CCL、OCF、CC等)上天然产物研究的最新成果。
1. Chemistry-A European Journal (IF: 5.020)│法国Olivier Grovel团队,结合靶向分子网络和半合成策略从海洋青霉菌中发现罕见的七环复杂生物碱

Communesins是一类罕见的七环生物碱,主要源于青霉属真菌。近期,法国Olivier Grovel团队,以一株海洋来源的扩展青霉(Penicillium expansum)菌株的提取物为研究对象,采用靶向分子网络的方法,检测到65个communesins生物碱(其中55个为新化合物)。通过建立二甲基乙烯基香豆素的裂解规律,建立脚本,以此预测其结构并将所有香豆素映射到一个全局分子网络中。采用半合成策略从分离得到的两个共生藻素A和B中获得了一些次要的共生藻素。以分离得到的communesins A和B为原料,采用半合成策略得到一些微量的communesins类产物。共合成了9个communesins生物碱:其中两个为该菌产生的已知化合物;4个为新天然产物并在提取物中得到证实;3个是迄今为止从未报道过的新的半合成类似物。
生物活性实验显示,化合物10对两种人癌细胞KB和MCF-7都具有较好的活性,其IC50值分别为4.8 μM和9 μM;化合物11对MCF-7的IC50值为6.3 μM。作者初步研究了这些化合物的构效关系,侧链R1的长度对活性有较大的影响,R3的环氧化和吲哚的N-甲酰化可以使communesins具有更高的活性。
文献: Chem Eur J. 2023, e202300103.
2. Organic Letters (IF: 6.072)│上海药物所岳建民院士团队,从海南草珊瑚中发现具有抗神经炎活性的吲哚与单萜杂合体Sarglamides A−E(点击了解详情)

近期,中国科学院上海药物所岳建民院士团队从海南草珊瑚中报道了一系列由反式-N-肉桂酰吲哚烷类和α -水芹烯衍生物聚合而成的异源二聚体Sarglamides A-E (1−5)。其中,化合物4和5具有罕见的6/6/5/6/5/5和6/6/6/6/5稠合的笼状五元环骨架。作者通过光谱分析、X射线衍射、量子化学计算和化学转化确定了化合物的结构。通过生源合成途径推测,发现该类化合物是主要是由α-水芹烯和toussaintine C 通过D-A加成反应聚合而成。抗炎活性实验表明,多个化合物(3−5、6a、6b、7)表现出较好的NO抑制活性,并且未表现出明显的细胞毒活性(细胞活力均大于80%)。
文献:Org Lett. 2023, 25, 1464.
3. Angewandte Chemie (IF: 16.823)│昆植所完成普通拟杆菌脂多糖十三糖的首次化学全合成

普通拟杆菌来源的脂多糖是治疗炎症性肠病的有趣靶点。然而,高效获得长的、分支的和复杂的糖链仍然具有挑战性。近期,中国科学院昆明植物研究所肖国志组采用基于糖基PVB的正交一锅糖苷化反应策略,实现了普通拟杆菌脂多糖十三糖的首次化学合成。该策略不仅加速了合成,还避免了基于硫苷的一锅糖苷化反应所潜在的问题。该合成路线具有以下特点:(1)采用二叔丁基硅基导向的糖苷化反应高立体选择性构建α-Kdo糖苷键;(2)采用酰基的远程参与效应高立体选择性构建α-岩藻糖糖苷键;(3)采用氢键介导的苷元递送策略立体选择性的构建β-甘露糖糖苷键;(4)策略性地使用正交保护基和正交一锅糖苷化反应实现寡糖的高效合成;(5)汇聚式的【1+6+6】正交一锅糖苷化反应高效合成目标分子十三糖。
文献: Angew Chem Int Ed. 2023, e202301351.
4. Organic Letters (IF: 6.072)│华中科技大学张勇慧团队,从真菌中鉴定抗炎α‑吡喃酮二聚体Talarolactones A-G及其生物合成途径

华中科技大学张勇慧团队从真菌(Talaromyces adpressus)中分离鉴定7个含新骨架的α -吡喃酮加合物Talarolactones A-G(1-7)以及2对α -吡喃酮单体[(±)-8、(±)-9)],通过现代波谱、Mosher衍生、Rh2(OCOCF3)4诱导圆二色谱(ECD)、X-射线单晶衍射等确定了化合物的平面结构和绝对构型。抗炎活性实验显示,化合物5和6对LPS诱导的NO的生成产生了显著的抑制作用,其IC50值分别为2.3 ± 0.1和3.7 ± 0.3 μ M。作者提出了可能的生物合成途径,并通过米曲霉异源表达证实了推测的合理性。
文献: Org Lett. 2023, 25, 1616.
5. 医科院药物所庾石山/张丹/屈晶合作STTT(IF:38.12)│有毒天然产物羟基马桑毒素致癫痫的作用靶点研究进展(点击了解详情)

庾石山课题组长期聚焦于有毒天然产物的研究与开发,羟基马桑毒素是从植物马桑(Cofiaria Sinica Maxim)中分离得到一种致癫痫的有毒天然产物,常用于急性癫痫模型的建立,但其具体机制尚未完全阐明。近期,中国医学科学院药物研究所科研团队(庾石山/张丹/屈晶课题组)首次使用热蛋白质组分析法(thermal protein profiling, TPP)和原代神经元发现钙调神经磷酸酶(calcineurin, CN)是羟基马桑毒素致癫痫的关键靶标蛋白,并通过多种分子生物学和生物物理实验证实羟基马桑毒素与CN催化亚基的活性位点结合。同时,羟基马桑毒素在体内外多种实验中可激活CN。利用脑电检测和行为学评分,发现CN脑内敲低或CN抑制剂FK506均可显著降低羟基马桑毒素诱导的小鼠癫痫发作强度,并进一步减轻致癫痫过程中的小鼠脑内的神经元损伤。同时机制研究发现,NMDA受体、GABA受体和BK通道可能参与了羟基马桑毒素致癫痫的过程。本文充分揭示羟基马桑毒素作用靶点和作用机制,为癫痫的治疗和药物开发提供了新的思路。
文献: Doi, 10.1038/s41392-023-01312-y.
6. Journal of Agricultural and Food Chemistry (IF: 5.895)│西北农林科技大学韩文博组,从青海地衣共生真菌中发现结构新颖的植物生长调节剂(点击了解详情)

西北农林科技大学韩文博课题组近年来一直致力于“特殊环境”微生物(尤其是共生菌)骨架新颖代谢产物多样性挖掘及药物先导结构发现。近期,该课题组从采自青海地衣的共生真菌Phaeosphaeria sp.液体培养基中发现了6个骨架新颖的色烯-吡喃酮杂合体。值得一提的是,这些杂合体是通过罕见的亚乙基桥连接形成,这在天然产物中极为少见!目前报道含有亚乙基桥结构的天然产物仅有4个,均来自真菌。活性测试表明,化合物1−8具有显著的植物生长调节作用(即低浓度促促进高浓度抑制),尤其对双子叶植物选择性更好,因此可作为新型植物生长调节剂进行开发。该研究首次揭示了高海拔特殊环境真菌中一系列骨架新颖的聚酮化合物,丰富了聚酮的结构类型,并为新型生物农药的研发提供了结构多样的候选分子。
文献: J Agric Food Chem. 2023, 71, 11, 4615–4624.
7. Bioorganic Chemistry(IF: 5.307)│中国医学科学院药物研究所张东明团队,从锦鸡儿中发现的具有降糖活性的二苯乙烯多聚物(点击了解详情)

作者从锦鸡儿[Caragana sinica (Buc'hoz) Rehder]枝条中获得的6个新的手性二苯乙烯低聚体carastilphenols A-E (1-5)和(–)-hopeachinol B (6),以及3个已知的二苯乙烯低聚体leachianol (7)、α-viniferin (8)以及cis-ampelopsin E (9)。Carastilphenols A-D、leachianol为二苯乙烯四聚体;carastilphenol E、(–)-hopeachinol B、α-viniferin以及cis-ampelopsin E (9) 为二苯乙烯三聚体。通过ECD计算的方法,首次确定了二苯乙烯四聚体的绝对构型,为二苯乙烯低聚体类化合物的结构确证提供了依据。部分化合物表现出显著的对PTP1B酶和α-葡萄糖苷酶的抑制作用,为降糖药物的开发提供了新的来源。
文献: Bioorg Chem. 2023, 134, 106458.
8. Chemistry-A European Journal (IF: 5.020)│上海药物所郭跃伟组,从南海软体动物血红六腮中发现罕见倍半萜分子

近日,中科院上海药物所郭跃伟课题组,从中国南海西瑁岛海域的软体动物血红六腮(Hexabranchus sanguineus)中发现12个新颖的倍半萜化合物,包括一对六氢螺[茚-2,3'-吡咯烷]新骨架差向异构体,并通过波谱学分析和改良Mosher法修正了一对已知呋喃倍半萜的相对构型。生物活性实验显示,化合物20对H1975、MDA-MB-231、A549和H1299肿瘤细胞株具有显著的细胞毒性(IC50为0.87-1.95 μM),与阳性对照阿霉素(IC50 0.12~1.90 μM)相当;化合物2对Streptococcus parauberis KSP28、S. parauberis SPOF3K和Photobacterium damselae FP2244具有中等抑制活性,其最小抑菌浓度(MIC)值为12.5 μg/mL。
文献: Doi, 10.1002/chem.202300457.
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