男性泌尿生殖系统发育和疾病单细胞数据交互式网站 — MHA

发表标题：MHA, an interactive website for scRNA-seq data of male genitourinary development and disease

发表期刊： Andrology（IF:4.456）

网站链接：http://malehealthatlas.cn/

合作单位：中山大学附属第五医院/上海市人民第一医院

中科普瑞提供服务：协助网站搭建

网站介绍:

MHA（Male Health Atlas）数据库是首个针对男性泌尿生殖系统特有器官发育与疾病的单细胞数据库网站，提供了简单快捷式的交互式、可视化、易于操作的在线基因表达数据查询网站，以更好地帮助泌尿外科、男科、生殖医学科等领域的研究人员。

样本情况：

MHA数据库的当前版本包括两个物种(人和小鼠)，五个男性特异性组织和器官(睾丸、附睾、输精管、阴茎海绵体和前列腺)和八个主要细胞类型。

数据收集及分析方法：

该数据库中数据从已发表的研究中下载，基于Seurat R软件包进行处理，包括质量控制、细胞聚类、降维及可视化图生成，并根据相关论文或识别的细胞标记区分细胞类型标注。输入和可视化结果通过Shiny包输出。

网站功能：细胞聚类和基因展示

在聚类中，访问者可以自由改变细胞降维(tSNE或UMAP)、调色板和标注(细胞类型或样本类型);基因表达部分包括降维散点图、小提琴图和气泡图。参观者可以很容易地查看单个或多个基因的表达特征，并比较不同细胞类型或群体之间的表达差异

使用方法：