Chelex-100 从干血斑中提取 DNA
Chelex-100提取DNA准则
来自干燥血斑的疟原虫DNA是通过在5%Chelex 100的悬浮液中加热样品来提取的。在碱性悬浮液中加热到近100ºC会破坏细胞膜并分解蛋白质,包括热不稳定的酶,而Chelex 100(一种离子螯合剂)通过灭活核酸酶和螯合可能破坏寄生虫DNA的重金属来限制DNA的破坏。这种方法使得获得适合PCR的寄生虫DNA成为可能。它是一种快速,廉价,有效的DNA提取方法。由于这是PCR过程的第一步,因此保持无菌技术以防止提取的DNA污染非常重要。
Chelex-100提取DNA所需材料和设备
1.5毫升微量离心管
1-20 μl 单通道自动移液器
100-200μl单通道自动移液器
1000 μl 单通道自动移液器
上述移液器的过滤器移液器吸头
细笔尖记号笔
圆珠笔
纸巾或湿巾
蒸馏水
磷酸盐缓冲液 (PBS)
烧杯或洗瓶中的漂白剂 (5%)
烧杯或洗瓶中的蒸馏水
烧杯或洗瓶中的乙醇 (70 %)
Chelex-100 树脂
剪刀或 1/8 英寸打孔器(如果使用打孔器,请加上备用滤纸)
定时器
微量离心机
加热块或 56 ºC 水浴
沸点水浴(96 ºC 或以上)
涡流
Chelex-100提取DNA程序步骤
要记住的要点:
确保在开始手术前彻底清洁剪刀,在
在切割滤纸之间和程序结束时。 不干净的剪刀
可能导致样品交叉污染和质量差的结果。
确保移液器吸头质量高、无菌且不含核酸内切酶。
请勿触摸移液器吸头。
确保定期校准和清洁移液器。
1. 打印一份 PCR 工作表并记录每个待测 DBS 的样本 ID单独的编号行。
2. 收集所有必需的用品。注意。 如果样品已在 +4 ºC 或 -20ºC 下储存,则必须将它们带到房间样品袋开封前的温度。
3. 收集所有必需的用品。通过加入蒸馏水(例如 0.2 g Chelex 和 10毫升蒸馏水)。注意: Chelex 试剂应根据需要每天新鲜制作。
4. 将剪刀或打孔器浸入乙醇 (70%) 中并通过火焰。
5. 标记适当数量的 1.5 ml 微量离心管(盖上两个盖子和试管的一侧)带有工作表编号和样品 ID。
6. 切割 2-3 块 3 mm x 3 mm 或打孔 3 mm 圆盘(可容纳约 3-5 μl干血)从滤纸中取出,放入相应的 1.5微量离心管或 96 孔微量滴定板的孔。
注意: 按照步骤 5 中的详细说明清洁每个样品之间的剪刀。用干净的滤纸冲孔 3 次。
7. 加入 1 毫升 PBS。注意: 确保滤纸浸泡在缓冲液中。
8. 室温孵育 10 分钟。
9. 14,000 rpm 离心 2 分钟,用干净的每个样品的移液器吸头。
10. 加入 1 毫升 PBS
11. 14,000 rpm 离心 2 分钟,用干净的每个样品的移液器吸头。
12. 加入 150 微升无核酸酶水。
13. 加入 50 微升 20 % Chelex。
14. 99 ºC 孵育 10 分钟。
15. 14,000 rpm 离心 1 分钟。
16. 将上清液储存在 +4ºC 以用于 PCR。注意:如果样品储存时间超过一天,请将上清液转移到新鲜的微量离心管并储存在 -20 ºC。