易基因：DNA甲基化研究的3大前期探索性实验思路｜干货系列

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近些年以来，DNA甲基化研究一直是顶级期刊、基金资助、临床研究、药物研发上市的多重热点，其研究方向涵盖疾病发生发展、疾病标志物研究、环境因素暴露与响应、发育和分化等多维度。

研究人员为DNA甲基化课题申请作准备以及为降低DNA甲基化实验风险，通常会进行DNA甲基化研究的前期探索性实验，主要包括：

• 检测DNA甲基化酶和去甲基化酶的表达

• 检测整体DNA甲基化水平变化

• 其他前期实验

一、检测DNA甲基化酶和去甲基化酶的表达

方法包括：

• RT-qPCR检测mRNA表达

• Western blot检测蛋白质翻译

e.g. 高脂饮食组和肥胖人群中均观察到DNMT的RNA和蛋白质表达上调

二、检测整体DNA甲基化水平变化

方法包括：

• 5mC甲基化免疫荧光染色（定性）

• DNA斑点杂交（定性）

• 比色法（定量）

• 质谱法（定量）

斑点杂交（Dot blot）

免疫荧光显微观察

比色法/质谱法

三、其他前期实验

在没有条件开展甲基化相关前期实验的情况下，也可以开展其他预实验。包括：

• 关键表型指标测定

• 转录组（成本低廉）