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质粒小提、中提、大提实验

2022-03-05 14:13 作者:可可西里良人  | 我要投稿


1 前言说明

本课题组质粒提取主要使用的是大肠杆菌转化细胞(DH5α),其质粒转化实验主要依据产品说明书。

而质粒小提、中提、大提主要是提取量的差异,由于量的差异导致操作有些许不同,本实验方案是收纳及归纳个人在实验过程中的执行方案。

2 质粒小提

2.1实验设备及材料信息

2.1.1 试剂盒信息

QIAGEN Plasmid Midi Kit(12143)

2.1.2 离心机信息

型号:Eppendorf 5424R

适合离心管:1.5ml/2.0ml

最大转速:21130g/15000rpm

2.1.3 分光光度计信息

型号:NANO-ONE

序列号:YN-N01-026

输入电压:DC12V

生产公司:杭州佑宁仪器有限公司

2.2实验操作程序

1.取2ml菌液至2ml离心管中,离心:8000g-2min-25℃,结束后弃上清

2.沉淀中加入250ul P1 buffer(从冰箱中取用,注意是否已加(RNase I and blue),并吹打至重悬混匀(吹打应当轻缓)

3.加入250ul P2 buffer,立即温和颠倒混匀5-10次(溶液呈蓝色),充分混匀,室温静置2min

4.加入350ul P3 buffer,立即温和颠倒混匀5-10次(溶液蓝色消失),静置2min

5.离心:20000g(最大转速)-10min-25℃,结束后将上清转移至吸附柱

6.离心:9000g(最大转速)-30sec-25℃,弃掉收集管中的液体

7.在柱中加入500ul DW1(去蛋白),离心:9000g(最大转速)-30sec-25℃,弃掉收集管中的液体

8.加入500ul Wash Solution,离心:9000g(最大转速)-30sec-25℃,弃掉收集管中的液体(重复2次)

9.将空吸附柱再次离心,离心:9000g(最大转速)-60sec-25℃

10.将吸附柱转移至新的离心管中,在吸附柱膜中央加入30ul ddH2O,静置3-5min,之后离心:9000g(最大转速)-60s-25℃

11.使用分光光度计检测小提浓度并做好记录,例:质粒完整名称-浓度(ng/ul)-提取时间-操作者

3 质粒中提

3.1实验设备及材料信息

3.1.1试剂盒信息

QIAGEN Plasmid Mini Kit (12125)

3.1.2 离心机信息

型号:Eppendorf 5430R

序列号:5428EL5243

适合离心管:15ml/50ml

最大转速:7197g

3.1.3 分光光度计信息

型号:NANO-ONE

序列号:YN-N01-026

输入电压:DC12V

生产公司:杭州佑宁仪器有限公司

3.2实验操作程序

1.经过大摇(培养基50ml)培养12-16h的细菌,转移至50ml的离心管中

2.离心:4℃,6000g,15min

3.离心后,弃掉培养基,加4ml P1 Buffer (注意是否已加RNase I and blue,4℃储存)重悬(温和吹打,充分混匀)

4.开始加入4ml P2 Buffer(裂解液),静置5min(时间要求精准),上下混匀或者摇匀10次(P1有显色剂,加入P2后,则溶液变蓝)

5.时间到后, 立即加入4ml P3 Buffer,停止裂解,上下混匀或者摇匀直至蓝色消失,埋入冰中,静置15min

6.时间到后,离心:4℃,7197g(离心机最大转速),60min

7.离心结束后,取出,用擦手纸充当滤纸进行过滤,转移至另一个50ml离心管(注意从沉淀侧对侧倾倒液体)

8.与此同时,将吸附柱放在50ml离心管上,加4ml QBT过柱子(待用)

9.步骤7过滤后的上清液转移至吸附柱(收集废液离心管可以用旧的,减少浪费)

10.当吸附柱无液体流出后,加入20ml QC Buffer(分两次,每次加10ml),与此同时,将QF Buffer放入烘箱预热50℃

11.取15ml 离心管,用封口膜和吸附柱缠在一起(扎几个孔),向吸附柱加入5ml QF Buffer

12.当吸附柱无液体流出后,拆开封口膜,在离心管中加入3.5ml 异丙醇(观察到灰白色液体层,上下颠倒混匀,后离心,异丙醇的作用是沉淀DNA)

13.离心管离心:4℃,7000g,60min,弃上清(会观察管底侧有白色斑点,即DNA沉淀)

14.向离心管中加入70% 乙醇 2ml(从冰箱里拿),4℃,7000g,30min

15.步骤14弃掉上清后,打开盖子,待乙醇挥发干净,加入100ul ddH2O,进行溶解(放入烤箱10min

16.使用分光光度计测浓度,先用溶解DNA的稀释液ddH2O作为空白对照,后吸取提取产物1ul 测定浓度并记录,例:质粒完整名称-浓度(ng/ul)-提取时间-操作者

4 质粒大提

4.1实验设备及材料信息

4.1.1试剂盒信息

The EndoFree Plasmid Maxi Kit (cat. no. 12362)-QIAGEN

4.1.2 离心机信息

型号:Eppendorf 5430R

序列号:5428EL5243

适合离心管:15ml/50ml

最大转速:7197g

4.1.3 超微量分光光度计信息

型号:NANO-ONE

序列号:YN-N01-026

输入电压:DC12V

生产公司:杭州佑宁仪器有限公司

4.2实验操作程序

1.将摇菌200ml的菌液(12-16h)分装转移至50ml离心管中(管壁,盖子做好标记)

2.离心:4℃,6000g,15min(注意配平问题)

3.离心后,弃掉培养基,加10 ml P1 Buffer (注意是否已加RNase I and blue, 4℃储存)重悬(移液枪吹打,少许振荡混匀也行)

4.开始加入10 ml P2 Buffer(裂解液),静置5min(时间要求精准),上下混匀或者摇匀10次(P1有显色剂,加入P2后,则溶液变蓝)

5.时间到后, 立即加入4ml P3 Buffer,停止裂解,上下混匀或者摇匀直至蓝色消失

6.组装过滤管(底部盖子旋拧过滤管)(此时推塞不要安装)

7.将步骤5所获全部转移至过滤管(两管倾斜30°左右转移,注意不要洒出),静置10min

8.此时,准备4只50ml离心管备用(管壁,盖子做好标记),待步骤7静置结束后,旋开底部盖子,上部安装推塞,将液体转移至准备OK的离心管中。

9.于步骤8过滤液体中加入2.5ml的Buffer ER(去除内毒素),于冰上静置30min

10. 与此同时,将吸附柱放在50ml离心管上,加4ml QBT过柱子(待用)

11.将过滤液体缓慢倾倒在吸附柱

12.当吸附柱无液体流出后,加入60ml QC Buffer(分两次,每次加30ml)

13. 将向吸附柱转移至新的50ml离心管中,并向吸附柱中加加入15ml QN Buffer洗脱DNA

14.弃掉吸附柱,向洗脱后的液体中加入10.5ml 异丙醇(0.7倍洗脱所得液体体积)

15. 离心:4℃,7197g,60min,弃上清(注意配平问题)(会观察管底侧有白色斑点,即DNA沉淀)

16.向离心管中加入70% 乙醇 5ml(从冰箱里拿),4℃,7197g,30min,弃上清(注意不要弃掉沉淀DNA,可能会漂浮)

17.打开盖子,待乙醇挥发干净,加入200-500ul ddH2O,进行溶解(溶解液体视沉淀DNA大小而定)

18.使用分光光度计测浓度,先用溶解DNA的稀释液ddH2O作为空白对照,后吸取提取产物1ul 测定浓度并记录,例:质粒完整名称-浓度(ng/ul)-提取时间-操作者


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