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深度学习法-- 基于基因分型的数据排序鉴定与蚕豆中毒和定殖含量相关的调节性SNP

2021-01-07 23:35 作者:geneXplain  | 我要投稿

微信公众号: geneXplain

geneXplain很高兴与您分享另一个TRANSFAC®应用程序的出色示例,该实例是在bean系统中的应用!

最近的出版物“深度学习法-- 基于基因分型的数据排序鉴定与蚕豆中毒和定殖含量相关的调节性SNP ” 描述了可控制蚕豆中有毒化合物合成的调节剂的鉴定。 在该研究中,通过使用MATCH™程序以及从TRANSFAC®数据库获得的非冗余植物位置权重矩阵(PWM)库,可以鉴定出预计会影响转录因子结合的SNP。

本文全文可在此处获得 https://lnkd.in/gY3gudW

图示: CNN启动子预测的网络体系结构由四个1D卷积层,一个平坦层和两个完全连接的层组成。 最后,具有一个神经元和乙状结肠激活功能的输出层计算被分析序列被分类为启动子序列的概率。


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