新品来袭丨博奥晶典引进10x Visium CytAssist空间组学组织分析物转移系统

细胞及其在组织内与组织间的关系对于理解正常发育和疾病病理至关重要。空间组学技术可以弥补单细胞测序没有空间位置信息的缺憾，在组织背景下对基因表达进行定位和定量。FFPE 样本可以长期保存病理信息，同时可以溯源如疾病诊断、预后等临床信息，具有很高的临床科研价值。但 FFPE 样本固定时福尔马林的使用和保存时间久等原因，会导致核酸存在不同程度的降解，使其在空间基因表达的研究中富有挑战。

2021 年推出的基于 10x 公司的 Visium FFPE 产品很好地解决了 FFPE 组织样本转录组分析难题，但是该技术依然存在很多问题和挑战。

问题一：珍贵样本已经贴在普通玻片上，无法转移

问题二：切片面积大于捕获面积，希望只针对感兴趣的区域进行研究

问题三：研究需要更大的切片面积

问题四：重要的石蜡样本保存时间太久，质检不合格

问题五：样本切片太少，不满足黏附测试及质检需求

问题六：病理科石蜡样本不允许带出医院

为了解决以上问题，博奥晶典引入了最新的 10x Visium CytAssist 空间组学组织分析物转移系统，为 FFPE 样本的空间组学研究拓展了新方向，下面跟着小编一起了解一下吧。

Visium CytAssist 仪器介绍

Visium CytAssist 是一款轻便小巧且易于携带的台式仪器，搭配全新升级试剂，可以轻松进入您的实验室完成FFPE空间转录组实验。它的使命是将 FFPE 组织切片上的探针捕获的转录组信息从普通载玻片转移到 Visium 建库芯片上，实现组织切片的空间组学分析。比如病理科存档贴在普通载玻片上的FFPE样本现在就可以通过 Visium CytAssist 进行分析了。

Visium CytAssist 工作流程

在 Visium CytAssist 工作流程中，在普通玻片上进行的是 FFPE 组织切片的脱蜡、染色、成像、解交联和探针杂交；然后，将两个普通玻片和一张含有2个捕获区域（6.5 mm x 6.5 mm 或者 11 mm x 11 mm）的 Visium 建库芯片放入 Visium CytAssist 仪器中，使普通玻片上的组织切片与 2 个 Visium 捕获区域对齐；随后，通过 Visium CytAssist 仪器捕捉明场图像，确定感兴趣的病理区域；最后，Visium CytAssist 将普通玻片组织切片上的转录组信息转移到 Visium 捕获区域，Visium 捕获区域通过带有不同位置标签的探针捕获转录组信息，从而获取石蜡切片不同空间位置的转录表达水平。

Visium CytAssist 优势展示 

样本类型 Plus+ 

可同时兼容普通石蜡块样本、标准载玻片上的预切片组织、及存档的盖玻片样本等，通过 Visium CytAssist 系统将分析物转移到 Visium 建库芯片上，进一步扩展了样本类型。

选片低风险 

可以先通过 H&E 染色确定要分析的正确切片，聚焦感兴趣的切片区域，然后再进行分析物转移，极大的避免了样本选片不合适造成的样本浪费。

面积更灵活 

新增加了更大面积的 11 mmx11 mm 捕获芯片，同时可在 6.5 mmx6.5 mm 或 11 mmx11 mm 的反应区域灵活选择感兴趣的病理区域。

质控更友好 

质检标准降低为 DV200>30%，可检测更多高降解度的样本。

检测配置大升级 

更高组织粘附性，跟预实验 say goodbye；三对探针对，人的高表达基因精准捕获。

凑样更自由 一张芯片从四个点阵减少至两个点阵，不再担心凑样难的问题。
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博奥晶典科研服务事业部 蒲叶丨文案

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