看看差距有多大,R语言edgeR差异表达分析
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小伙伴们大家好啊,小果今天给大家带来的是差异表达分析,小果觉得,虽然差异表达分析的方法已经很多了,但多掌握一项总是好的,今天小果给大家带来的是edgeR的用法。



#关于exactTest的pair参数,两个组的顺序决定了logFC的正负,按照这个顺序,计算时middle组除以big,再求log2的值,如果是正的,就说明相对于big组,middle组发生了上调。
exactTest的帮助文档原文如下
这样就能得到我们的结果了,包括log2FC,P值等,这些都是筛选关键基因的重要指标。
好了,今天的内容就是这样了,小伙伴们有什么问题欢迎来和小果讨论。
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