【青莲聚焦】空间蛋白质组学技术上线：揭开蛋白质的空间密码

在细胞和组织内部，蛋白质的位置和相互作用非常重要，它们直接关系着细胞的结构和功能。传统蛋白质组学存在一定的局限性，首先是细胞类型的异质性方面，传统蛋白质组学由于是对整块组织进行处理，因此得到的质谱结果是多种细胞中蛋白质的mix数值，不能体现具体是哪种细胞的差异；其次是肿瘤异质性方面，同一肿瘤中可存在有很多不同的基因型或亚型的细胞。因此，我们需要一种能够分析蛋白在不同空间位置表达的新技术，这就是空间蛋白质组学。

空间蛋白质组学是指通过在样本不同空间位置的区域进行取样，分析蛋白在不同空间位置的表达量；与全组织水平的分析相比，空间蛋白质组学可以获得组织内不同细胞和功能区域的蛋白表达谱；与单细胞水平的分析相比，空间蛋白质组学可以获得空间位置特异性的蛋白表达信息；空间蛋白质组学可以精细获得组织内不同细胞和功能区域的蛋白表达谱。通过将空间与细胞类型信息与蛋白质组数据联系起来，从而深入了解组织空间微环境并发现更精准的生物标志物和新的功能机制。

空间蛋白质组学解决的问题

1、样本在不同的空间位置进行取样，分析蛋白在不同空间位置的表达量；

2、与传统的蛋白质组学相比较，可以得到不同的细胞和区域的蛋白质组的数据；

3、可以进行全景式扫描，进行组织空间蛋白质水平的全覆盖；

空间蛋白质组学原理

核心在于通过高精度激光捕获显微切割技术 (LCM) 技术切取感兴趣的组织区域或细胞，经过优化的超微量样本无损提取并酶切蛋白为肽段，进而使用高灵敏度质谱，分析蛋白在不同空间位置的表达特征。

空间蛋白质组学分析技术流程

主要的实验流程包括冰冻组织、OCT 包埋（蜡块）、切片、染色选择区域、切割、收集切割区域、蛋白前处理（蛋白质酶切）、质谱检测、数据分析。

通过空间蛋白质组学的研究，我们可以更全面地了解蛋白质在细胞内的角色和功能，揭示细胞的结构和功能之间的关联。这一领域的不断发展和技术的不断进步，将为我们深入探索生物系统的奥秘提供强有力的工具和手段。空间蛋白质组学的前景令人期待，它有望在各个领域带来重大的突破和进展。

技术特点与优势

1、MMI 激光显微切割系统，高精度激光捕获显微切割技术 (LCM) 技术助力切取感兴趣的组织区域或细胞；

2、利用单细胞处理流程，做到无损前处理；

3、青莲百奥引进timsTOF HT（国内首装），超高超灵敏的4D系统，较上一型号，增加了离子蓄集，提供更宽的动态范围；

4、专业的生信团队，负责的售后技术，一条龙服务。

可接受样本类型及送样标准

适用的样本类型：新鲜组织、冰冻样本、甲醛固定组织、包埋蜡块、FFPE

空间蛋白质组学高分文献

关于空间蛋白质组学技术就先介绍到这里，针对该技术，小编也整理了近些年的高分文献，希望能给您提供一些思路~