最适合生信专业的笔记软件（20211227更新）
年纪大了，反应也慢了，码代码都码的慢了。
曾经在游戏世界中叱咤风云被人膜拜的大佬，现在变成只会卖萌扣1抱大腿的咸鱼。
所以，需要在自己还能码的时候，尽可能多的把经验和代码记下来。
那么第一个问题就是：我记啥？
我把有记录需求的几点列在下面，之后分类推荐软件（主要为开源的软件）
知识类笔记：个人经验，代码等
实验记录笔记：日常记录，Todo list，项目规划等
合作类笔记：需要多个人一起做的项目相互交流
文献笔记：看文献的idea，关键信息等
第二个问题，什么样的笔记本软件是好的软件，我觉得：
记录方便，使用简单，不折腾（科研不易，笔记上不折磨自己）
查找方便（这也是为什么最好不用纸质的实验笔记的原因）
简单、美观得记录文字、图片、代码、公式 （markdown说，干脆你报我身份证号算了）
多设备多终端能用，支持多种云同步
版本管理，易于查找历史记录以及版本退回
易于导入导出，
这种软件真有吗？好像还真的有
由于新软件不断产生，老牌软件有可能会被替代，所以本博客不断更新。我先把我目前在用的软件写在前面：
20211227更新
知识类、试验记录：Joplin
合作类笔记：Notion
文献笔记：Zotero
接下来是各种笔记软件的介绍
Joplin （知识类和工作类笔记）
推荐指数：⭐⭐⭐⭐⭐
刚发现的宝藏软件，满足我全部需求。
特点：
所有数据全部本地，可以配置云盘和WebDAV同步，外加版本控制
markdown记录代码，文本，图片，公式
支持加密，区域搜索和全局搜索
支持导入markdown和evernote笔记，导出markdown，pdf，html
如果用官方cloud就可以分享、协作记笔记（没测试过）
目前发现的缺点：
没有图床，图全部存本地（也就是云盘）
VScode （全能IDE）
推荐指数：⭐⭐⭐⭐⭐
我的上一个笔记软件。其实vscode不能叫笔记软件了，应该叫编辑器或者IDE。vscode作为IDE太全能了，不仅写python，做前端好用，装上插件markdown也是一把好手。并且新版本网页端的vscode随时编辑github博客确实很给力。本地云盘建个文件夹
特点：
装上插件就是全能IDE。markdown，图床，导出，git，正则表达式搜索啥都有
可能的缺点：
我感觉markdown渲染速度有点慢
Zotero （强大的开源文献管理）
推荐指数：⭐⭐⭐⭐⭐
用过Endnote, Mendeley，最后还是用上了Zotero。功能强大，开源，多插件可用。可以自动提取pdf中高亮的注释，可分类，可做笔记。
优点：
开源
文献管理，文献插入，格式排版
高亮注释提取，文献笔记，标签分类，还有一点
可能的缺点：
官方同步空间太贵，通常我用网盘同步，偶尔会有冲突
上手会麻烦一点，插件配置好就完美了
Typora （开源的文献管理）
推荐指数：⭐⭐⭐⭐
极简的markdown笔记编辑器，我写博客偶尔会用，应该是不分屏的markdown编辑器中体验最好的吧。最新更新了付费版本，买断付费，不过同时支持免费版的下载。
优点：
完美的markdown笔记体验，极简好用
支持添加图床，全局搜索等
可能的缺点：
只能全局搜索，没有版本控制
Notion （网红的笔记软件）
推荐指数：⭐⭐⭐⭐
除了付费买空间，国内需要配置DNS或者科学上网之外，是个很不错的笔记软件。尤其是分享合作，插入表格、数据库都很好用。我用主要是老板买了团队版=-=
优点：
除了markdown，多人协作、图表展示以及统计运算，数据库查询都包含其中。
可能的缺点：
需要付费，国内不太容易同步，内容存在notion服务器等。
其他我还用过，后续会补充：
Zettlr 推荐指数：⭐⭐⭐⭐
有道云笔记 推荐指数：⭐⭐⭐
印象笔记 推荐指数：⭐⭐⭐
如果你有好的笔记软件可以通过留言推荐给我，我比较喜欢折腾~
