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6张图就能发12分生信分析文章?!看来中性粒细胞胞外诱捕网(NETs)这一热点千万不能错

2022-11-09 09:14 作者:尔云间  | 我要投稿

6张结果图=一篇12分+生信分析文章!你想不想要?

如果导师要你发一篇10分+的文章,你的第一反应是什么?

大概心理瞬间盘算了起来:

经费从哪里来,您给吗?

10分的课题思路我怎么设计?

我要做多少实验才能达到10分啊??

还得保证实验结果不错,才能发表。。。。

我的头发会不会更少了?!我还能和小伙伴愉快的玩耍了吗?



遇到这种情况你先别焦虑,别忘了还有机智的小云在这帮你出谋划策呀!

小云的秘笈就是通过生信分析来解决,让生信分析的内容占80%-90%,这样实验的内容不就少了很多了嘛,而且只要创新性够高,发10分+的文章也没那么难!

能用生信分析解决的问题都不是问题,欢迎来咨询小云,超多个性化、创新性高的分析思路供你选择!

今天小云就给你们介绍一个新热点-中性粒细胞胞外诱捕网(NETs)

NETs是由濒死中性粒细胞将染色质排出到细胞外空间的网状结构,其作用主要是杀死有害微生物。DNA染色质通过瓜氨酸化解聚,然后与瓜氨酸化组蛋白和含有颗粒酶的胞质内容物复合,从细胞中排出,这被称为“NETosis”。“NETosis”是一种有别于细胞坏死和凋亡的,中性粒细胞特异性的程序性的死亡方式。

不仅基于免疫细胞的分析又添新成员—中性粒细胞,而且细胞花式死亡也增添新花样—NETosis!

而且,除了感染性疾病,NETs在非感染性疾病中也发挥作用,包括糖尿病、动脉粥样硬化、癌症、创伤等。总之各种类型的肿瘤和炎症性疾病均可做NETs方向的研究。


小云今天就带你看看,只有6张结果图,基于NETs进行的泛癌分析,是如何轻松的发一篇12分+生信分析文章的。

发表时间:2022年6月

发表杂志:Journal for immunotherapy of cancer

影响因子:IF=12.469

文章题目:基于中性粒细胞细胞外诱捕网(NETs)的泛癌预后特征


数据信息


研究思路

在泛癌数据中,分析69个NETs相关基因的表达水平,使用LASSO Cox回归模型构建基于19个基因的NETs评分,并分析其预测患者预后的价值。利用多种癌症类型的多个数据集用于验证NETs评分。还分析NETs与EMT、血管生成和细胞周期的相关性。最后应用免疫组化(IHC)进行临床样本的验证。

NETs评分模型构建与验证流程图


主要研究结果

分析发现NETs评分具有明显的器官特异性,来自大脑和胃肠道的肿瘤NETs评分一般较高,而来自某些分泌腺的肿瘤,如前列腺腺癌、甲状腺癌、乳腺浸润性癌(BRCA)的NETs评分通常较低。

分析内容直接看图:

文章小结

这篇文章的创新点就在于基于NETs进行了泛癌分析。分析内容不复杂,再加一点点验证实验,干湿结合还能够满足毕业需求。

而且不仅肿瘤、非肿瘤疾病也可以分析,就目前发文情况看,NETs相关的生信分析文章还不多,而且非肿瘤疾病分析空间更加大哦!感兴趣的来Call小云吧!

如果老板/导师再要求你发10分+的文章,分分钟把这篇文章甩给他看,然后自信满满的跟他说:不就10分+嘛,看起来也没那么难嘛!只要创新性在手,既可以发一篇高分生信,也可以基于分析结果设计后续的实验课题。再以此帮你申请个国自然。。。

好啦。。。即使不能完全按照上述剧本走,也给你提供了一个热点方向,小云还是诚意满满的!

如果您想设计NETs或者其他方向的生信分析思路,但是时间和精力有限,小云可以提供如下服务:免费评估服务、付费设计服务、定制化生信分析等超多个性化、创新性高的分析思路供你选择!别忘了还有精品培训课程肿瘤微环境和免疫治疗课题思路介绍及热点方向分析》《线粒体和细胞死亡》等培训课程,欢迎咨询哦!


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