生信分析中的列线图看不懂?看这里
尔云间 一个专门做科研的团队

小伙伴们,大家好呀,很高兴和大家见面,最近看到有果粉提问关于列线图的问题,之前呢有写过关于如何做列线图,以及列线图的一些基础知识的推文,如果有小伙伴需要,可直接在往期里面查找就可以了,今天呢我们来聊聊关于如何进行列线图读图。走神的,还没有准备好的小伙伴快来看这吧。
我们通过往期内容知道列线图长什么样,大概就是像下图这样的。

当小伙伴拿到这样一张图时,首先去看左边的名称,小编这张图中左边的名称分别为Points,Age,RiskScore,Total Points,1-year survival,2-year survival,3-year survival,这些名称大致分为三类:
第一类为得分包括Points(单个变量的得分)和Total Points(所有单个变量得分的总得分)
第二类为变量,包括Age和RiskScore两个变量
第三类为预测概率,包括1-year survival,2-year survival,3-year survival,分别代表一年、两年、三年生存的概率。

列线图中每个名称均对应一个带有刻度的线段,代表了该变量的可取值范围,而线段的长度则反映了该因素对结局事件的贡献大小。比如图中的Age变量,对应的线段是20-90,可以说明年龄的取值范围是20-90。Age变量的线段总长度对应到Pointsf的得分为25,也就说明Age变量对结局事件的贡献为25;对Age变量线段的最远端做垂线,这里要说明这个线段是我们自己读图时自己加上去的,实际上并没有这个垂线,可以发现Age变量垂线在1-year survival上的刻度位置为0.58左右,说明Age变量对应的一年生存率大概为0.58左右。
当然小伙伴在实际的分析中可能会遇到多个变量,分析的方法也是一模一样,小伙伴需要学会举一反三。
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