在做miRNA分析时，大家可能想知道miRNA的质控和mRNA是不是一样呢，两者有什么区别呢

小云在这里要告诉大家miRNA和Mrna的质控是不同的哦！miRNA和mRNA是两种不同的RNA类型，具有不同的功能和结构。

miRNA是一种非编码RNA，其长度通常在21-25个核苷酸之间。miRNA可以通过抑制mRNA的翻译或降解mRNA来调节蛋白质的表达水平。miRNA在生物体内扮演着重要的调节基因表达的作用，参与了许多生物学过程，如细胞周期、细胞分化、细胞凋亡等。mRNA是一种编码RNA，其长度通常在几百到几千个核苷酸之间。mRNA是从DNA转录而来的，它携带着编码蛋白质的信息，可以被翻译成蛋白质。由于两者结构（长度）的特异性，所以在质控时具体参数要进行调整哦！

和小云一起来学习如何对miRNA进行质控吧！

首先就是大家熟知的fastQC，对miRNA原始数据质控得到结果：

由于小RNA测序建库时会测到3'端的接头序列，所以需要进行接头的去除和质量的过滤。使用cutadapt进行3'端接头的去除以及长度控制。去除3'端接头序列后，与mRNA的区别就是miRNA仅保留17-35nt的reads作为潜在的miRNA序列。

从上图我们能看到，接头类型是Illumina Universal Adapter，经过小云的百度发现其接头序列为AGATCGGAAGAG，所以我们在服务器使用脚本运行cutadapt：bash 脚本名

#!/bin/bash

all_fastq=$(ls *.fastq.gz)  ##修改为你的文件格式后缀

for each in ${all_fastq}; do

    cutadapt -a AGATCGGAAGAG --minimum-length=17

--maximum-length=35 \    ##接头序列以及最小最大长度设定

     -o "${each%.*}_trimmed.fastq.gz"  $each

done

经过上面的操作，我们就得到了质量较高的miRNA数据，怎么样是不是很简单呢？欢迎和小果讨论哦！