蛋白质Bottom-up方法

基于质谱的蛋白质组学研究方法主要可分为“自下而上”（Bottom-up）和“自上而下”（Top-down）两种策略。其中，“Bottom-up”策略需要先对蛋白质进行酶切，通过质谱检测酶切生成的小分子肽段进一步实现多种蛋白质分析，这种从局部到整体的研究蛋白质的分析思路类似于基因组鸟枪法测序技术，因此又称为鸟枪法蛋白质组学。

“自下而上”蛋白质组学质谱研究策略是目前最成熟、运用最广泛的蛋白质分析技术，在蛋白质定性定量鉴定、一级结构测定以及蛋白质翻译后修饰情况分析包括修饰类型、修饰位点以及修饰水平等方面具有重要意义。常见的蛋白质定量技术如Label Free、iTRAQ、TMT以及SILAC等都是基于“自下而上”策略进行的。

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