CNVpytor学习日志2
1.构建自定义参考数据库
2.使用自定义数据库必须创建ref_genome_conf.py.文件
3.创建conf.py之后,所有cnvpytor的命令都要加上-conf参数
例如:
创建好之后就可以开始callCNV啦

4.根据GitHub上给的基础命令,批量生成每个样本CallCNV的脚本:
用法:创建一个bam/cram文件前缀的list之后直接运行此脚本👆


5.这是批量生成脚本中的一个,检测名为sample1的个体的raw_CNV

1.构建自定义参考数据库
2.使用自定义数据库必须创建ref_genome_conf.py.文件
3.创建conf.py之后,所有cnvpytor的命令都要加上-conf参数
例如:
创建好之后就可以开始callCNV啦
4.根据GitHub上给的基础命令,批量生成每个样本CallCNV的脚本:
用法:创建一个bam/cram文件前缀的list之后直接运行此脚本👆
5.这是批量生成脚本中的一个,检测名为sample1的个体的raw_CNV