1.正义链/反义链 定义 2.正负链 定义 3.两种定义的区分

一. 正义链 / 反义链定义：

mRNA转录时结合的那条链称之为模板链，即碱基互补配对的那条链，那么由此可知非互补的链是非模板链。

根据碱基互补原则我们可以知道，

非模板链的碱基顺序和mRNA是一致的

（除了其中的U/T替换）。显然，这条非模板链对于mRNA是有意义的，存储着mRNA的编码信息，因此这条链也被称为编码链（coding strand）或者正义链（sense strand）。mRNA的序列信息对应着编码链5'->3'方向的序列信息（碱基顺序一致）。有了编码链就肯定有非编码链，所以模板链也就是非编码链或者反义链。

模板链 = 反义链 = 非编码链

非模板链 = 正义链 = 编码链 

(碱基顺序和mRNA是一致的

（除了其中的U/T替换）

二.  

正负链 定义：

DNA是双链的，对于一个参考基因组，一条链被指定为正链forward，那么另一条就是负链 reverse。这种定义是十分硬核的，并没有什么生物学意义。如果非要说有什么意义，那么可能就是为了世界各地的命名规则统一，使得研究更为方便。

英文中通常将正负链写为

forward / reverse

 strand，有时也会使用

plus / minus

 strand表示。

总结一下就是：

把序列与mRNA一致（只是T和U的区别）的核酸单链定为正链（+），不作模板转录，也称为有义链（sense strand）, 又称编码链（coding strand）;

而将碱基序列与mRNA互补的核酸单链定为负链（-），作为模板转录，也称为反义链(antisense strand)或模板链(template strand)。

正链（+）forward strand= 非模板链 = 编码链（coding strand）= 正义链 / 有义链（sense strand）

负链（-）reverse strand= 模板链 = 非编码链（noncoding strand） = 反义链 / 无义链（nonsense strand）

三.以上二者定义的区分

两者是不同的定义方式，正义链反义链具有生物学意义，而正负链只是简单的规定。

当说一个基因位于正链上时，其含义是该基因的编码链位于正链上。这意味着在该正链基因的转录期间，RNA聚合酶从负链读取基因的模板序列，产生与正链上的序列对应的mRNA。通常来说，我们所谓的基因可以粗暴的理解为是编码链DNA序列。

我们都知道启动子是一段位于基因5'端上游的DNA序列，也就是说

启动子位于基因编码链的5'端上游。那么在模板链上，启动子序列位于基因的3'端。

顺式/反式调控元件也是如此。

基因的位置：一个基因位于正链或者负链的其中一条链上。我们知道，一个基因既有编码链信息（或者说是正义链sense strand），也有模板链（也可以说是反义链 nonsense strand）。

大概50%的基因其模板链位于正链(forward strand)上，而另外50%的基因其模板链位于反链（reverse strand）上

。因此，我们可以知道正链上既可以有一个基因的正义链信息，也可以有另一个基因的反义链信息。当然，一个基因的正义链信息位于正链上，那么它的反义链信息只能位于负链上。

DNA的方向：我们都知道DNA的方向是5'->3'方向，但是这在正负链上是如何表现得呢？在正链（forward strand）上，这个方向是从左往右的。而在负链上，这个方向是从右往左的。

在转录过程中，RNA聚合酶沿着编码链DNA以5'->3'方向移动（比如，若编码链位于正链上，则RNA聚合酶是沿着DNA从左向右移动）。聚合酶从模板链上读取碱基信息，并不断合成mRNA序列。因此从模板链的角度来看，聚合酶是从3'->5'方向移动。

DNA的复制、转录的方向都是从5'往3'方向延伸，沿模板链3'往5'方向；翻译的方向是N往C，沿模板链5'往3'方向。

来源：简书（生信师姐）