一个小众的CoRE MOF看板程序,帮你8s筛选想要的MOF!
我们在之前的推文中向大家推荐过不少的cif下载网站。
其中也包括非常适合MOF研究的数据库,比如COD数据库。
具体使用方法如下:

直接在标识地方输入MOF的惯用名,然后点击send就可以了。

此处收集的MOF多是挺多的,但是质量参差不齐。
有很多MOF是带有分数占据或者直接有原子缺失之类的。
说到专业的MOF结构数据库CoRE MOF应该是最全的了。
这个数据库目前看下来更适合做高通量计算的原料库。
该库地址https://cmcp-group.github.io/CoRE-MOFs/,大家可以下载2019版查看。
其实下载下来就是一万多个cif的打包。但是命名方式和大家平时惯用的MOF俗名不太一样。
说白点,资源全是全,但是不知道哪个是你需要的。
接下来,介绍一个CoRE MOF看板程序。
该看板其实是对CoRE MOF附带的某个表格文件的信息的汇总,方便大家更加直观进行MOF材料的筛选。
https://github.com/AndreyBezrukov/CoREMOF_dashboard
https://coremof-dashboard.herokuapp.com/
可以指定下面散点图的XYZ坐标轴的选取参数
Largest Cavity DiameterPore Limiting DiameterLargest Free Path DiameterDensityAvailable Surface Area m2/cm3Available Surface Area m2/gNot Available Surface Area m2/cm3Not Available Surface Area m2/gAvailable Volume FractionAvailable Volume cm3/gNot Available Volume cm3/g
其中Z轴是以颜色标识的。
页面最下方还有一个可对Z轴数据进行区间筛选的工具。
可以在这里限定上方选好的Z的参数。
稍等几秒,上面散点图中的点便会基于调整的区间重新显示。
此时把鼠标放到上面的散点的点上,就可以看到对应的MOF的名字。
然后去从CoRE MOF中下载的cif压缩包找到对应名字的即可。
https://zenodo.org/record/3677685#.XzqXbZMzY8M
散点图中的点还是比较密的,有没有什么办法能够局部放大查看?
当然有,仔细观察右上角。

当然,通过主界面可以看出还可以通过MOF中金属类型以及是否无序和存在Open Metal Site (OMS),无序不用解释,做MOF研究的老师和同学没少头疼这个问题。
至于OMS,如果有同学不太明白,强烈建议阅读一下。
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jced.9b00835这也是CoRE MOF 2019的原文。
我个人很希望CoRE MOF可以出个俗名对照表,这样能够让该资源也可以被我们这些常人所用。
当然 ,如果是我的认识浅薄导致未能好好利用该数据库,还请在评论区点拨一下。