gelred核酸染料（介绍、存储处理、使用方法、应用）
GelRed简介
GelRed 是一种嵌入核酸染料，用于分子遗传学的琼脂糖凝胶 DNA 电泳。 GelRed 在结构上由两个由线性氧化间隔物桥接的乙锭亚基组成。GelRed 是一种荧光团，其光学性质与溴化乙锭基本相同。
gelred化学结构式
当暴露在紫外线下时，它会发出橙色荧光，与 DNA 结合后会强烈增强。 该物质作为溴化乙锭的毒性更小、更敏感的替代品上市销售。gelred 和 EtBr 具有几乎相同的光谱（下图），因此您可以直接用 gelred替换 EtBr，而无需更改现有成像系统。 此外，gelred 远比 EtBr 灵敏。
GelRed 是一种非常稳定的染料。 我们建议您存储在室温下 10,000X 水溶液。储存在较低的温度，如 4℃. 可能发生染料沉淀。在长期低温储存期间，发生这种情况时，加热45℃热水浴中的溶液
50℃ 两分钟和/或涡旋解决方案。 染料的 1X 和 3X 工作溶液可以是在室温下避光保存至少一年。 长期储存时应避免光照。 但是，染料可以常温在环境光下处理，染色过程中不会出现任何实验问题。
Gelred 使用方法：
GelRed可以预制到琼脂糖凝胶中，但是GelRed可能会影响到预制胶中DNA样品的迁移率和分辨率，因此推荐使用凝胶后染色法（泡染法）。在聚丙烯酰胺凝胶中不推荐使用预制凝胶的方法，最好用泡染法。GelRed染色凝胶适用于下游的应用，如克隆、连接和测序。通过苯-酚/氯仿抽提和醇沉淀能够有效地将DNA中的GelRed移除。
A. 预制凝胶法
1. 常规方法准备熔化的凝胶。预制胶法不适用聚丙烯酰胺凝胶，对于聚丙烯酰胺凝胶请使用泡染法。
2. 将GelRed（10,000X）原液以1:10,000比例加入到熔化的凝胶中，混合均匀。（GelRed可在加热后的凝胶冷却至45℃左右时添加。）
3. 倒胶，室温放置等待凝固。
4. 按常规方法上样电泳。（注：预制胶中橙色的G示踪染料和GelRed不兼容。）
5. 观察染色凝胶使用标准的透照仪(302或312 nm)，成像使用溴化乙锭滤光器，SYBR或GelStar滤光器凝胶成像也可以得到很好的结果。
6. 未使用的含有GelRed的预制凝胶可以重新熔化做胶，为保证最佳荧光信号，酌情添加适量染料。不建议长期储存含有GelRed熔化形式的琼脂糖。含有GelRed的预制胶可以保存在4℃供下次使用。
B. 泡染法
1. 按照常规方法进行凝胶电泳。
2. 稀释 GelRed ：用水将10,000X储备液稀释3300倍制成3X染色液。通常情况下50mL染色液足够染一小块凝胶。（注：染色液中含有0.1 M NaCl能增强灵敏度，但可能会促使凝胶染色出现沉淀。）
3. 把凝胶放于合适的容器，如聚丙烯染色托盘中。添加足量的3X染色液至浸没凝胶。
4. 室温缓慢振荡染色30min。注：最佳染色时间根据凝胶厚度以及琼脂糖浓度不同略有不同。对于含3.5-10%丙烯酰胺的凝胶，染色时间通常介于30min至1h，并随丙烯酰胺含量增加而延长。
5. 不必脱色，必要的话可以水洗以降低背景值。
6. 使用标准的透照仪(302或312 nm)观察染色凝胶，成像使用溴化乙锭滤光器，SYBR 或 GelStar滤光器凝胶成像也可以得到很好的结果。
7. 染色液可重复使用2-3次，室温下避光保存。
Gelred 应用：
1. DNA或RNA的电泳;
2.预制或电泳后染色;
3.琼脂糖、聚丙烯酰胺、DGGE、EMSA、PFGE 或甲醛凝胶;
4.限制性内切酶作图;
5.PCR扩增子检测;
6.印记杂交;
7.DNA 条带纯化、克隆和测序;
8.COMET 检测;
9.毛细管电泳;
