世界上没有白费的努力--至少在科学研究中不假

      1932年胡适先生在北大毕业致辞中说所有的努力都不会白费。而我们有谚语“瞎子点灯白费油”，我们在做很多努力以前都会担心自己的努力付之东流，所以想寻找一个保险箱，考公热就是具体的体现。这是一个宏大的话题，我就说说自己在科学研究中的体会吧。

      硕士研究生期间在迷茫中摇摆，读的书对我影响比较大的是査全性老师的《电极过程动力学》，感觉写得好，但自己距离如此系统地认识特定物理过程或对象相去甚远。后来在读博士做博后期间一直随大流，羡慕发明星期刊文章的同行，也无法不随大流，因为自己依然找不着北。从本科，硕士，博士到千年博后，从化工机械到材料腐蚀实验到材料计算到生物计算到分子生物学实验，晃晃悠悠20年很快过去了，我在迷茫中回到中国开始了自己的独立研究。很多研究者在这个年龄已经有所成就，而我还不知道自己真正想干什么。不过兜兜转转期间掌握了一些基本工具和不同学科的常规思路。

       独立研究的开始我依然陷于对大文章大项目的羡慕中摇摆，但在博后后期萌发的用概率描述分子体系的想法开始越来越强烈地支配我的努力，复杂分子体系计算方法的现状也让我越来越不安于延伸主流方法。我在迷茫中寻找合适的工具和表述，也在这个过程中发现了一些问题表述的缺陷。比如溶剂化自由能计算中的界面自由能，这个问题的困难在于直接把宏观问题中定义清楚的界面引入到微观体系，但界面在微观分子体系中压根就没有合适的定义，大家都觉得很难算，却从来没有人（至少在我所读到的文献中）质疑这个问题本身的定义！我就提出了广义溶剂化自由能理论，基本思想是分子体系中每个组成单元的溶剂就是它周围的其他单元，而这个单元本身就是它周围其他单元的溶剂组成部分，传统的溶质溶剂定义和伴随的模糊界面定义被彻底抛弃。虽然这一理论发表文章影响因子很低，在提出三年后的今天几乎无人知晓，我觉得以自己的方式定义问题还是非常非常有意思的，自此慢慢发现定义问题才是根本，也逐渐开始较为系统地思考尝试如何在喧嚣中定义自己的问题，这期间又接触到机器学习花了我不少时间，但以往的一个个点正在被连起来，或者作为工具的一部分，或者作为思想的一部分。广义溶剂化自由能理论后来的继续发展形成了局部分布理论，与历史上所有分子体系增强采样通过形式多样的手段有效平滑自由能面为出发点，该理论以减少局部重复采样计算为出发点，当然这一理论依旧在发展初期，但也算是一条独立的道路。

      这些发展逐渐形成了我非常朴素简单的算法发展思想，就是通过适当地定义问题消除无效和重复计算。这期间树立了我发展高维问题经典新算法的信心（物质世界中也许没有维度灾难问题，我会专门写简单论述这一观点的专栏），我现在正在发展的序列比对新算法和其他智能生物算法发展都基于这一思想。

       这些努力虽然没有产生改变世界的科学成就，但却已经给了我足够的自信和快乐。如果你正在迷茫中坚持，请相信自己！