小云带你学绘图之相关性分析ggcor包
不管你是苦逼的医学生、还是更苦逼农学、生物学生,相信相关性分析一定是你科研路上要攻克的重要分析之一。相较于方差分析、聚类分析,相关性分析原理较为简单,这里小云就不再赘述了。今天的重点是绘图,话不多说,泡上一杯枸杞,代码开撸。
说起相关性分析,就不得不提相关性神包:corrplot(膜拜魏太云老师),尽管corrplot有着绝美的默认配色,唯美的画风,劳模般的更新速度。但终究是被显著性打倒。Corrplot不能在相关性r值的右上角增加显著性标识,这一点注定了corrplot的图不能用于发paper。那么问题来了,有什么包可以在r值右上角增加显著性标识吗?有请我们今天的主角:linkET。
曾几何时ggcor也是江湖上响当当的R包,但目前ggcor已经停更,好在github还有备份的ggcor,接下来就由小云带大家学习一下ggcor包吧。
首先是下载ggcor包,不能直接install.packages,需要用devtools安装

ggcor是基于ggplot2开发的包,把ggplot2一起导入了准没错

接下来掌声有请我们的老演员之mtcars数据集闪亮登场


效果还可以,再把r值和显著性标记图层填充上去


完美,再修改下颜色字体字号什么的,这妥妥的发表级相关性图嘛。


