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[BioLadder云平台] 不会编程也可以轻松画出词云图!

2022-01-14 10:01 作者:青莲百奥  | 我要投稿

大家好!我是BioLadder生物信息在线可视化云平台的工程师小宇,今天我来给大家分享怎样用BioLadder画出常用的词云图

如果您反馈问题,报告Bug,提出新的需求,请直接在公众号内发留言给我哦!为感谢您对BioLadder的认可我们还有星爸爸同款收纳包相赠哦!小宇先谢谢大家喽!

1.什么是词云图?

“词云”由美国西北大学新闻学副教授、新媒体专业主任里奇·戈登于2006年最先使用。戈登做过编辑、记者,曾担任迈阿密先驱报新媒体版的主任。他一直很关注网络内容发布的最新形式——即那些只有互联网可以采用而报纸、广播、电视等其它媒体都望尘莫及的传播方式。通常,这些最新的、最适合网络的传播方式,也是最好的传播方式。
 “词云”就是通过形成“关键词云层”或“关键词渲染”,对文本中出现频率较高的“关键词”进行视觉上的突出。词云图过滤掉大量的文本信息,使浏览者只要一眼扫过文本就可以领略文本的主旨。本文我们就来讨论一下词云图是如何绘制的以及如何对其进行解读。

用BioLadder云平台画词云图

2.绘图前的数据准备

demo数据可以在

https://www.bioladder.cn/shiny/zyp/bioladder2/demoData/wordcloud/wordcloud.zip下载。

本工具支持两种数据格式,一种是词频,另一种是一段话。

2.1 词频

必须要有列名,名称自定义。第一列为名称,第二列为名称对应的数量。


2.2 一段话

支持中文和英文,工具会自动将其拆分为词,并统计个数


3.BioLadder生信云平台在线绘制词云图

不想写代码?可以用BioLadder生信云平台在线绘制词云图。

免费使用,登录后畅享50+模块

网址:https://www.bioladder.cn/web/#/chart/20


3.1 导入数据文件

1. 选择导入文件的类型。文件类型说明请参照之前的“绘图前的数据准备”。


2.在左下角的文本框粘入对应类型的数据


3.2 调整参数

根据需求调整参数即可

• 选择图案形状:有圆形,四边形,三角形,五角星图案可供选择

• 选择字体大小:设置字体大小,一般字体越小,图案的轮廓越清晰


3.3 提交查看

上传完数据,并调好参数后,点击右上方“提交”按钮,图像会出现在左侧。如果没有上传自己的数据,会使用默认的demo数据绘图。

3.4 下载

• 点击图片下载中的下载按钮,下载词云图

• 点击词频表格下载中的下载按钮,下载生成的词频表格


4. 词云图结果解读


词云图是通过使每个字的大小与其出现频率成正比,显示不同单词在给定文本中的出现频率,然后将所有的字词排在一起,形成云状图案,可以以多种形状排列,圆形,五角星或其他形状。在词云图上使用颜色通常都是毫无意义的,主要是为了美观。


5.BioLadder云平台

网址:https://www.bioladder.cn/

BioLadder目前上线了生物学分析最常用的50多个模块,主要包括以下四类:

数据可视化:箱线图,南丁格尔玫瑰图,韦恩图,UpSet图,饼图,词云图,核密度图,小提琴图,弦图,柱形图等

组学数据分析:序列的多重比对,表达数据的CV曲线图,PCA,T-SNE,热图,相关性热图等,趋势分析的mFuzz,差异分析的火山图,富集分析的气泡图,修饰位点上下游模体分析的seqLogo,Motif热图等

功能分析:GO弦图,相互作用网络图,富集分析

数据预处理:归一化,补值,FDR校正,长宽表互换等

好了韦恩图的绘制就到这里了,后续大家想要了解什么内容可以给我们评论反馈,我们会根据大家的意见持续更新。我们欢迎您以任何方式提出您的优化意见,使BioLadder平台成为广大科研工作者的生物信息分析首选平台!

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