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SCI新宠“孟德尔随机化”,简单几张图表发表IF 8.8+SCI !

2023-08-24 17:03 作者:科研根号三  | 我要投稿

如果说最近临床科研领域中最火的是什么,除了chatGPT,应该就是孟德尔随机化了。利用公开数据库就能轻装上阵写文章,甚至是高质量的论文。比临床更简单、发文速度快、需做实验!

 

Frontiers in immunology杂志(IF:8.786)的一篇孟德尔随机化研究。纵观全文,利用孟德尔随机化(MR),简简单单几张图表,就揭示了叶酸和维生素B12与自身免疫性疾病的关系,还发表了IF 8.8+的SCI,不得不感叹,孟德尔随机化果然是SCI的新宠儿!

检索Pubmed数据库可以发现,过去10年全球发表的有关孟德尔随机化方法的文章数量近4500篇,而2022年更是达到顶峰的1695篇。连年攀升的发文量,彰显出孟德尔随机化方法的热度越来越高!

对MR学习有兴趣的可以继续看,文末也分享了全套学习资料给大家!

 

孟德尔随机化,Mendilian Randomization,简写为MR,是一种在流行病学领域应用广泛的一种实验设计方法,基于全基因组测序数据、能有效减少偏倚、类似于RCT研究、用于揭露因果关系的统计学方法。


1、MR分析特点与优势

•借助工具变量进行随机化,模拟随机对照研究,从而达到统计学优势。

•优势包括:证据级别高,可以避免偏倚,可以避免反向因果关系,同时又比随机对照研究更省钱、省力。

 

2、MR必须满足三大假设

•相关性假设:SNP与暴露强相关

•排他性假设:SNP与结局无关

•独立性假设:SNP与混淆因素无关


3、MR分析流程

•获取暴露与结局的GWAS数据;

•在暴露GWAS数据中挑选工具变量;

•在结局中找到对应的工具变量信息;

•孟德尔随机化分析,敏感性分析

 

4、MR公共数据库推荐

利用公开数据库就能轻装上阵写文章,这里推荐几个数据库

①GWAS catalog

网址:https://gwas.mrcieu.ac.uk/

优点:可多种方式进行搜索(publications、variants、traits、genes、region等),表型信息规范缺点:有时候需要开国外代理模式才能使用,网页比较慢

②nealelab

网址:http://www.nealelab.is/uk-biobank

优点:数据全面,整理很有条理

缺点:英国数据库,完整版需要花钱注册(UKB数据使用费用分为三档:3000英镑/6000英镑/9000英镑),有免费不需要注册的2018年版本数据,但数据时间可能会相对滞后。

③IEU OpenGWAS project

网址:https://gwas.mrcieu.ac.uk/

④PheWeb全表型组关联研究

网址:https://pheweb.jp/downloads

 

5、MR学习全套资料分享

继meta分析、纯生信之后,孟德尔随机化作为一个不做实验发SCI的新代名词,目前确实是火爆趋势。

有想继续学习或者了解的小伙伴,这里给大家分享一套孟德尔随机化研究的学习资料,包含MR理论、范文拆解、写作、选题,通过近9小时的学习带你打开孟德尔随机化研究的大门!

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