如何使用在GEO数据库中使用GEO2R
尔云间 一个专门做科研的团队
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GEO2R简介
GEO2R是GEO数据库中基于limma算法对原始提交者提供的处理过的芯片表达数据（即数据类型为表达谱芯片）进行差异表达分析的一种交互式的在线分析工具。
使用步骤
01 进入到GEO数据库中，在搜索框中输入需要查询的GEO编号，点击search之后，就会在查询结果中看到有Analyze with GEO2R 蓝色按钮，此时我们也就找到了GEO2R分析工具的入口。这里我们以GSE70493为例，来查找GEO2R分析工具。
02 对数据进行分组，插入分组的位置为图中红色方框圈中的位置。如何分组需要我们去浏览查询结果来确定样品分组，这里我们以两组为例，自定义创建control和traet两个组，即对照组和实验组。
03 选择对应的样本，为了方便进行分组统计可以先对某一个列名进行排序，这里我们对列名为gestational diabetes的列进行排序，然后在数据表中选择对应的分组数据。
04 进行差异分析，把界面往下拉，下图中红色方框中圈住的地方即是查看结果的地方，点击红色箭头所指的Analyze按钮进行分析。
05 查看分析结果，分析结果包括Visualization和Top differentially expressed genes（top250）两大分析结果，该结果中包含volcano plot，mean-difference plot，UMAP plot，venn diagram等,Top differentially expressed genes的结果可以点击Download full table 进行下载保存，用于后续分析。
以上为GEO2R的简单使用的分享，至于结果解读请关注后续更新哦。
