蛋白质N端测序方法：Edman降解法or质谱法
N端是一个蛋白质或多肽的起点。它影响蛋白质的亚细胞分布、降解和转化率。因此，蛋白n端序列分析对于蛋白质功能研究具有重要意义。此外，在药物蛋白质中经常观察到一些N端的变化，包括N端信号序列的不完全处理、焦谷氨酸盐的形成、以及N端甲硫氨酸残基的去除缺乏。因此，N端测序是一项重要的质量控制分析。ICH Q6B也要求对药物进行N端序列确认。
Edman降解法N端测序：Edman测序反应是一个循环过程，N端氨基酸残基被反复裂解，可使用色谱法对分离出的氨基酸进行鉴定。因偶联和裂解反应的效率不是100%，限制了可测序的残基数。
优点：1. 可以准确分析N端氨基酸序列，特别是能辨别异亮氨酸和亮氨酸、谷氨酰胺和赖氨酸；2.直接分析氨基酸信息，不需要任何蛋白质数据库。因此，它可以识别未登记在数据库中的未知蛋白质；
缺点：1. N端已被化学修饰或封闭的肽不可用；2. 低通量分析。
关于样品：蛋白质可以以SDS或天然聚丙烯酰胺凝胶片的形式在溶液中，或印迹到PVDF膜上提交。
溶液中：样品应无干扰缓冲液、盐和洗涤剂。如果干扰缓冲液、盐不可避免，清理后仍有可能对材料进行测序。应避免缓冲液中的胺(如Tris、乙醇胺和甘氨酸)。
凝胶中：将感兴趣的凝胶切片切下来，放入微量离心管中。蛋白质可以从聚丙烯酰胺中洗脱下来。凝胶染色尽量使用考马斯蓝R-250或G-250代替银染色剂。
PVDF膜上：将SDS-PAGE分离的蛋白质印迹在PVDF膜上。蛋白质可以用考马斯蓝R-250、酰胺黑、胭脂红S或Sypro Ruby染色(不建议银染)。
