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第一性原理||CASTEP计算电荷密度差分及绘制电荷密度差分图

2022-04-01 14:50 作者:唯理计算  | 我要投稿

电荷密度差分(Charge density difference)是研究电子结构的重要手段之一。可以直观的得到各个片段相互作用后的电子流向,或者原子形成分子过程中电子密度的变化、探究化学键的本质。往期文章中,我们讲解了


如何通过VASP来计算电荷密度差分,计算方法比较简单。然而,使用CASTEP可以更简单快速地计算出电荷密度差分。


以AlFe合金为例,其具体操作如下:


01优化结构


导入要计算的结构文件,选择CASTEP模块,点击Calculation,打开以下对话框,选择Geometry Optimization


     


02得到优化后的结构

在包含计算输出文件的目录下,选择CASTEP模块,点击Analysis,打开以下对话框。选择Structure,在Results file处导入后缀为castep的计算输出文件,点击Update。



03设置差分片段


首先,点击Edit,选择Atom Selection,打开如下对话框,点击要选择的片段,这个根据需要,自行设置。设置好后,点击Select后,被选择的片段则被标亮。



其次,点击Edit,选择Edit Sets,打开如下对话框:



点击New,命名DensityDifference,点击OK即可。此时,在结构上可以看到被选中的片段被标记出来。


04计算电荷密度差分


将上一步得到的结构进行电荷密度差分的计算,选择CASTEP模块,点击Calculation,打开以下对话框,选择Energy,在Properties处选择Electron density difference。设置完成后,进行计算。    



计算结束后,在包含计算输出文件的目录下,选择CASTEP模块,点击Analysis,打开以下对话框。选择Electron density difference,在Results file处导入后缀为castep的计算输出文件,点击Import。



05电荷密度差分图的绘制


上一步操作后,在得到带有差分电荷密度的结构的同时,通过利用工具栏中的各项功能及应用,可以得到想要效果的展示图片。



下面将对常用工具能进行简单介绍:


1)利用图1中“Create Slices”功能,可以选择沿着想展示的面进行切面;


(图1)



2)利用图2中“Volumetric Selection”功能,可以选择想展示的切面;


(图2)


3)利用图3中“Color Maps”功能,可以自行修改电荷密度等值面的大小,以及修改颜色的展示;


(图3)


以上经过对各项工具的功能应用,就可以快速得到如下图所示的电荷密度差分图了。


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