Linux批量低质量trim的小trick

记录原因：trim_galore 对raw reads进行low quality reads or base 进行trim的时候是单线程运行的，速度较慢，有一些浪费时间，所以为了让其多线程运行，查阅的相关资料后，总结了一下多线程运行trim_galore的方法，以节约时间。本记录为了帮助自己记忆，如有错误欢迎指正。

软件需求：

trim_galore; parallel

多线程质控：

1，针对图1创建命令文件：

2，第一步完成后就会生成一个名为parallel.txt 的文件，然后我们进行多线程运行：

这样我们就可以多线程进行raw reads的低质量剪切，如图 3，多个trim_galore正在运行。

参考：

https://www.gnu.org/software/parallel/parallel.html#example-working-as-cat-sh-resource-inexpensive-jobs-and-evaluation