「青莲聚焦」蛋白质组学FAQ蛋白产品相关问题（二）

蛋白质组学（英语：proteomics，又译作蛋白质体学），是以蛋白质组为研究对象，研究细胞、组织或生物体蛋白质组成及其变化规律的科学。这个概念最早是在1994年，由Marc Wikins首先提出的新名词。

上周二分享了蛋白产品相关问题（一），本周二将分享蛋白产品相关问题（二）~

现在小编将带您进入今日主题

6. iTRAQ/TMT蛋白组学分析的优点是什么？

答案：通过不同分子量的实际对不同来源样品进行标记的方式，实现不同样品间蛋白质组比较的目标，两种方法都一次性完成（iTRAQ 8个/TMT 16个）全部样品的定性定量分析，降低了实验误差，排除仪器造成的样本间差异，稳定性更高，操作简单，数据分析流程简单，适用于所有物种蛋白的定量分析。

7. TMT 对仪器有哪些要求，目前有哪些仪器可以做该实验？

答案：TMT试剂标签之间的质量差额在0.006Da左右，需要质谱二级分辨率在50K以上才能准确分辨出不同的报告离子，因此只有在高分辨质谱仪上才能完成标记定量实验。主流仪器有Thermo fisher QE系列质谱仪、fusion系列质谱仪、AB sciex QTOF系列质谱仪。

8. 我们公司的标记实验流程？

答案：蛋白质提取，出具蛋白质控报告，反馈客户，肽段酶解，多肽标记，HPLC分馏分，质谱数据采集，数据分析出具结题报告。

9. iTRAQ&TMT 标记实验时需注意哪些问题，对样品有什么要求

答案：iTRAQ&TMT适用于相同组织的相对定量分析，不能进行有或无的鉴定，不能将不同的组织部位一起标记上机，更不能将不用物种的样本一起上机；对蛋白总量需求较LFQ要高，100ug以上。

10. 不同组织类型的样本做 iTRAQ /TMT能否同组上机？

答案：同一批上机的样本必须是相同物种、相同组织类型才能一批上机和一起分析。搜库时是鉴定其共有蛋白，差异分析也是共有蛋白在定量值上的差异倍数FC。如果选择不同样本类型的样本，他们的特异性蛋白就会被过滤掉。

本周的FAQ就到此结束啦~

有任何困惑或见解欢迎交流哦！

我们下周不见不散~