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常见的冠状病毒(3)——人冠状病毒HKU1(HCoV-HKU1)

2021-04-13 11:57 作者:制御秘书长杜鹃  | 我要投稿

        今天介绍的是人冠状病毒HKU1(Human Coronavirus HKU1,HCoV-HKU1)。

组装中的冠状病毒(蓝色圆形)

简介

        人冠状病毒HKU1(HCoV-HKU1)是人体内的一种冠状病毒,是β冠状病毒属的厄贝孔冠状病毒(Embecovirus)属的成员。它会导致上呼吸道疾病,并伴有普通感冒症状,但可能会发展为肺炎和细支气管炎。它于2004年1月在香港的一个人中首次发现。随后的研究表明它具有全球分布和较早的起源。

        该病毒是一种有包膜的,正义的单链RNA病毒,它通过与N-乙酰基-9-O-乙酰基神经氨酸受体结合而进入宿主细胞。它具有血凝素酯酶(HE)基因,使它在β冠状病毒和厄贝孔冠状病毒(Embecovirus)属中,变得特立独行。

历史

        HCoV-HKU1于2004年1月首次发现,当时是一名71岁的男性,由于急性呼吸窘迫综合征和X线摄影证实双肺炎而入院。 该名男子最近从中国深圳返回香港。

病毒学特征

冠状病毒
冠状病毒生活史

        吴教授和他的同事尝试从HCoV-HKU1中生长细胞系的尝试均未成功,但能够获得完整的基因组序列。 系统发育分析表明,HKU1与小鼠肝炎病毒(MHV)的关系最密切,在这方面与其他已知的人β冠状病毒,例如HCoV-OC43截然不同。

        当分析RNA依赖的RNA聚合酶(RdRp),棘突蛋白(S)和核衣壳(N)基因时,发现不相容的系统发生关系。对22株HCoV-HKU1菌株进行了完整的基因组测序,证实这是由于自然重组所致。HCoV-HKU1可能起源于啮齿动物。

        HCoV-HKU1棘突(S)和血凝素(HE)蛋白的结构已分别由Cryo-EM在2016年和2020年解决。  S蛋白因其大尺寸而闻名。血凝素(HE)蛋白与常规蛋白(例如OC43中的一种)的区别在于其残留的凝集素结构域要小得多。该结构域通过大小变化和糖基化作用被免疫系统识别,以免被识别。

传染病学

       对2003年SARS期间患有呼吸系统疾病的患者的SARS鼻咽负向抽吸物进行追溯分析,确定了一名35岁肺炎妇女的样本中存在HCoV-HKU1 RNA。

       在最初发现HCoV-HKU1的报道之后,该病毒于同年在澳大利亚北部的10名患者中被发现。 在五月至八月之间(澳大利亚冬季)收集了呼吸道样本。 调查人员发现,大多数HCoV-HKU1阳性样本均来自冬季后期的儿童。

        西半球的第一个已知病例是在康涅狄格州纽黑文的耶鲁-纽黑文医院的临床病毒学家分析了较旧的标本后发现的,他们好奇地发现HCoV-HKU1是否在其所在地区。 他们对7个星期(2001年12月至2002年2月)收集的851名婴儿和儿童的标本进行了研究。9名儿童的标本患有人类冠状病毒HKU1。这些孩子在收集标本时患有呼吸道感染(一个女孩如此严重,需要机械通气),而其他原因如人类呼吸道合胞病毒(RSV)、副流感病毒(1-3型)、甲型和乙型流感病毒、腺病毒、人偏肺病毒和HCoV-NL63。

       2005年7月,法国报告了6例。 在这些情况下,法国研究人员利用改进的技术从鼻咽抽吸物和粪便样本中回收病毒。

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