【分子】0.4-0.5 CRISPR的修复与靶向系统


四、CRISPR的修复:NHEJ & HR
1.非同源末端连接(NHEJ)
无需额外同源序列,通过Ku蛋白,形成的异二聚体复合物(Ku 70/80),识别结合双链DNA断裂(DSB)末端。之后形成的Ku-DNA复合物可以招募并且激活DNA依赖性蛋白激酶催化亚基(DNA-PK)。接着DNA-PK自磷酸化,启动NHEJ通路,招募重组酶Artemis,到DSB的末端,进而绑定DNA连接酶复合物,将修复完成的DSB连接起来。
2.同源重组(HR)
首先,MRN复合物识别DSB,结合到DNA末端,MRN复合物和转录因子CtIP会引发末端切割,让5’端降解,暴露出3’端的单链DNA,这段单链会被复制蛋白A(RPA)包被,起到保护作用,以免外切酶降解。之后,BRCA2蛋白作为介导,RPA被重组酶Rad51替换,形成核蛋白丝。核蛋白丝进而寻找姐妹染色单体上的同源序列,在重组酶Rad51的介导下侵入DNA双链模板,与同源DNA序列配对形成D-Loop结构,D-Loop延伸或与另一个末端连接,完成修复。此过程发生在细胞周期的S或G2期。

五、CRISPR的RNA靶向系统——CRISPR-Cas13
1.Cas13的结构
(1)crRNA识别叶(REC, crRNA-recognition):NTD + Helical1
(2)核酸酶叶(NUC, nuclease):HEPN1-I、Helical-2、HEPN1-II、HEPN2
2.CRISPR-Cas13的作用机理
无需trRNA,由Cas13加工pre-crRNA并释放成熟的crRNA。与此同时,受crRNA中特定序列(22-28 nt)的介导,Cas13和crRNA复合物与靶向RNA结合。结合之前复合物无核酸酶活性,只有当两个RNA特异性结合,引发Cas13-crRNA复合体构象改变之后,才能激活HEPN结构域的活性。
crRNA和靶向RNA结合之后,会使两个HEPN结构域相互靠近,合成一个催化亚基。这个亚基距离两个RNA结合的双链区域有一定距离,令其无特异性切割单链RNA。
