单细胞研究未来的热点趋势——单细胞多组学ATAC+转录组
单细胞多组学 ATAC + 转录组是一种以数千个细胞为研究对象，同时分析同一细胞中的基因表达和开放染色质的技术，它可以带来细胞的基因表达谱及其表观基因组景观的一体化视图。随着单细胞测序技术的飞速发展，单细胞多组学已经成为单细胞技术发展的重要方向，很多研究者不再满足于只研究基因表达，其更注重探索基因表达背后的转录调控机制，于是染色质可及性研究成为众多研究者的选择。据统计，近 5 年来研究染色质可及性文章以平均每年 20.1% 的比例迅速增长，在 2021 年更是达到最高增长比例 31.1%。
随着研究需求不断增多，单细胞测序技术也随之飞速革新，2022 年樊荣团队在 Nature上发表了 Spatial-ATAC-seq，开启空间表观组学新篇章；南京科技大学在 Nature Method 上发布了单细胞多组学技术 ISSAAC-seq，实现在同一细胞内兼顾高低通量且同时进行 ATAC+ 转录组的测序技术，扩大单细胞多组学研究途径。这两项染色质可及性研究技术被评为单细胞测序技术的十大里程碑事件，推动了单细胞多组学技术的进一步发展。
目前单细胞多组学 ATAC+ 转录组解决方案广泛应用于各类研究成果中，已在 2021-2022 两年间支持 53 篇文章发表，其中包含 Nature 4 篇、Cell 3 篇、Science 2 篇[1]。这些文章从更深入地鉴定细胞类型和状态，通过表观基因组和基因表达谱的综合分析来鉴定复杂的细胞群体，并捕获细胞异质性，从而发现隐藏的信息，利用基因表达标志物解释表观遗传图谱；到发现新的基因调控相互作用，将调控元件的发现与基因表达相结合，探索驱动细胞分化、发育和疾病的基因调控相互作用，探索疾病的复杂性，了解疾病中的基因调控网络如何被破坏，研究表观遗传重塑和治疗耐药的机制。单细胞多组学充分利用您的宝贵样本，从同一细胞中获得转录组和开放染色质信息，让您从有限样本中得到尽可能多的发现。
注：[1] 数据来源2023年2月16日10x Genomics 官网
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