生物样本库∣核酸样本质控∣这些你都知道吗?
生物样本库(Biobank),又被成为生物银行。根据经济合作与发展组织(OECD)的定义,"生物样本库(Biobank)是一种集中保存各种人类生物材料(Human biological material),用于疾病的临床治疗和生命科学研究的生物应用系统"。根据GB/T 37864-2019《生物样本库质量和能力通用要求》等指导文件,生物样本库必须做好核酸质控,包括对DNA,RNA样本的纯度,浓度以及完整性做好检测。
核酸样本质控方法推荐
根据GB/T40974-2021《核酸样本质量评价方法》,分别对DNA和RNA样本的浓度、纯度、完整性提出了推荐的质控方法。 ● 浓度:.分光广度法、荧光染料检测法 荧光定量 PCR法和数字 PCR法 ● 纯度: 分光光度法和 琼脂糖凝胶电泳法 ● 完整性:凝胶电泳法, 毛细管凝胶电泳法(安捷伦Tapestaion分析仪) 和微流控分析法(安捷伦2100生物分析仪)
核酸样本质控
1、安捷伦2100生物分析仪 2100生物分析仪是核酸质控届的常青树,是国际生物和环境样本库协会(ISBER)《生物样本库最佳实践》,GB/T 40664-2021《用于高通量测序的核酸类样本质量控制通用要求》,GB/T 40974-2021《核酸样本质量评价方案》等指导文件中推荐的生物样本库核酸质控方法。 2100生物分析仪采用微流控芯片技术,样本进入芯片后,进行电泳分离。使用数字化评价体系,评估样本质量,其中RNA完整性指标RIN值是业内公认的金标准。
图 1 微流控芯片示意图
2、安捷伦Tapestation 分析仪
Tapestation 是安捷伦旗下推出一款独创的胶条式自动化电泳分析仪,也是国内外众多生物样本库核酸质控的选择。这款仪器自动化程度非常高,用预制胶条取代传统繁琐的制胶过程,胶条采用独立泳道,有效避免污染。
图 2 Tapestation 预制胶条
Tapestation 共有两款型号,提供灵活通量,减少单次上机成本。
一、 4150 TapeStation
– 从两个 8 联管上样
– 完整的可扩展性:可分析 1–16 范围内任意数量的样品
– 16 个样品在 20 分钟内即可获得可靠且可重现的结果
– 占地面积小,节省宝贵的实验室台面空间
二、4200 TapeStation
– 可对多达 96 个样品进行全自动样品处理
– 从两个 8 联管或一个 96 孔板上样
– 完整的可扩展性:可分析 1–96 范围内任意数量的样品
– 1–2 分钟内即可获得一个样品的可靠重现结果,90 分钟内可获得 96 个样品的结果
图 3 Tapestation 分析仪 ,型号4150(左),型号4200(右)
Reference:
1、GB/T 37864-2019《生物样本库质量和能力通用要求》
2、GB/T 40974-2021《核酸样本质量评价方案》
3、安捷伦5991-3143ZHCN
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