病毒分离
1.6 病料处理
采集病猪的小肠,剪碎后转入研磨器中,加入DMEM基础培养液,研磨成10%的组织悬液,反复冻融3次,3000r/min离心10min后取上清,用0.22μm微孔滤膜过滤除菌后,置-70℃保存备用。
病猪的粪便用DMEM基础培养液作10倍稀释后加入双抗(终浓度1000IU/ml青霉素、1000µg/ml链霉素)于4℃作用12h,离心取上清,用0.22μm微孔滤膜过滤除菌后,置-70℃保存备用。
1.7 RT-PCR扩增PEDV M基因
1.7.1 RNA的提取
取100mg组织样品用剪刀剪碎后,置于研磨器中,加入2ml的DMEM培养基,研磨至组织呈匀浆状,置-70℃冻融2~3次后,5000 r/min离心10 min后,取上清200µl至1.5 ml离心管,每管加入1 ml RNA-Solv® Reagent RNA Isolation Solvent,颠倒混匀,室温静置5~10min。每管加入200 µl氯仿,涡旋15 sec,严格冰浴10 min,4℃ 12,000r/min离心10min。取80%的上清转至新的1.5 ml离心管,加入500 µl异丙醇,混匀,室温静置10min,室温12,000r/min离心10min。弃上清,每管加入1.2ml无水乙醇和300µl DEPC水,轻微涡旋,7500r/min离心5min,弃上清,用枪头吸干残留水份,风干5~10min,最后加入20µl DEPC水溶解。紫外分光光度计测定A260及A280值,确定样品RNA含量及纯度,-70℃保存备用。
1.7.2 反转录合成cDNA
反转录体系按照表1加入。
表1 反转录反应体系
10×RT Buffer
1.0 µl
dNTPs (10mM)
1.0 µl
MgCl2
2.0µl
RNase Inhibitor
0.25 µl
ReverTra AceÒ
0.5 µl
Oligo(dT)20
1.0 µl
RNA模板
适量体积(0.2µg)
RNase Free H2O
加至终体积10.0 µl
反转录的反应程序为:42.0℃反转录30min,95.0℃ 5min,进行反转录。获得的cDNA用作PCR扩增的模板。
1.7.3 PCR扩增
根据GenBank 登录的PEDV(No.JQ282909)基因组序列设计一对特异性引物,扩增PEDV M基因(表2),引物序列为:
上游引物P1:5’-TTCCCGTTGATGAGGTGAT-3’
下游引物P2:5’-AAGCATTGACTGAACGACC-3’
扩增片段大小为552bp,引物由上海生工生物工程有限公司合成。
表2 PCR反应体系
10×Ex Buffer
2.5 µl
Ex Taq
0.125 µl
上游引物
0.75µl
下游引物
0.75µl
cDNA模板
5µl
dd H2O
加至终体积25.0 µl
反应条件为:94℃变性5 min后进入循环,循环参数为:94℃ 1min,54℃ 1min,72℃ 1min;35个循环后72℃延伸10min。
取扩增产物在0.8%琼脂糖凝胶上进行电泳,观察结果并拍照。
1.8 病毒分离
取经RT-PCR检测为PEDV阳性的病料悬液1ml接种已长成单层的Vero细胞(接种前倒掉细胞培养液,用PBS洗2次),并加入1ml的细胞维持液(含10μg/ml胰酶的无血清DMEM培养液),37℃吸附1h,吸弃接种物,补加5ml的细胞维持液,继续培养,每天观察,如出现细胞病变即及时收毒,如无细胞病变出现,则在培养72h时收毒,并继续盲传,盲传7代后仍无病变者弃去不要。

