Fmoc合成法采用Fmoc为α-氨基的保护基,侧链保护采用苄醇类。合成时将一个Fmoc-氨基酸衍生物共价交联到树脂上,用碱脱除Fmoc,用三乙胺中和游离的氨基末端,然后通过DCC活化、偶联下一个氨基酸,脱保护多采用HF法或TFMSA(三氟甲磺酸)法。