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科研代码分享|R可视化代码分享:基因与功能之间的关系--GO功能富集网络图绘制

2022-06-16 16:41 作者:尔云间  | 我要投稿

科研有捷径,输入代码,一键获取科研成果!就是这么省事,来具体看下有多方便!

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真香提示:文末可以知道如何获取代码~   

该图与一般功能富集柱状图和气泡图相比较的话,其优势在于可以清晰的展示出基因与功能的关系,哪些基因作用于什么功能。输入数据即为2列,一列是基因symbol,一列是差异倍数log2FC,通过本文中代码的学习,可以复现该图做法,得到以下图表结果:

1.      R包安装及下载

2.      示例输入数据

3.      SymbolentrezID转换

4.      GO功能富集分析

5.      可视化基因-功能网络图

如果你不喜欢环形风格,则可以利用同一个函数修改不同参数即可得到以下风格网络图,根据自己审美开始尝试吧。

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