时空日报 | 心脏适应压力过程中MyD88对降低心脏炎症至关重要

大家好，欢迎观看《时空日报》第23期。本期追踪到时空/单细胞组学相关研究文章共计3篇。以下是应用时空云平台STOmics Cloud的StereoCopilot模块生成的文章概要，并辅以人工审核，供了解参考。

1、T细胞MyD88是通过调节T细胞活化来调控心脏纤维化的新调节因子

T-cell MyD88 is a novel regulator of cardiac fibrosis through modulation of T-cell activation

Circulation Research; IF: 20.100; DOI: 10.1161/CIRCRESAHA.123.323030

内容概要：对T细胞中缺乏MyD88的小鼠进行主动脉缩窄并分析其重塑、收缩功能、存活和T细胞活化情况，结合scRNA-seq等分析，发现MyD88通过TCR依赖性信号调节T细胞的激活和存活，从而限制T细胞的活化，减轻心脏炎症反应；缺乏T细胞MyD88会导致心脏T细胞浸润和纤维化的增加。这一发现为心脏适应应激过程中调节心脏炎症反应提供了新思路。

2、背外侧前额叶皮层的单核转录组学分析：包括17q21.31位点在内的神经元基因表达在PTSD应激反应中的机制作用

Single-nucleus transcriptome profiling of dorsolateral prefrontal cortex: Mechanistic roles for neuronal gene expression, including the 17q21.31 locus, in PTSD stress response

The American Journal of Psychiatry; IF: 17.700; DOI: 10.1176/appi.ajp.20220478

内容概要：通过scRNA-seq探究创伤后应激障碍（posttraumatic stress disorder，PTSD）和重度抑郁症（major depressive disorder，MDD）患者的背外侧前额叶皮层（ dorsolateral prefrontal cortex，DLPFC）细胞类型特异性的转录组病理学，揭示了PTSD和MDD中大脑应激反应的细胞类型特异性机制，强调了检测细胞类型特异性基因表达的重要性，并指出了有希望的新生物标志物和治疗靶点。

3、乙二醛为scRNA-seq分析的替代固定剂

Glyoxal as alternative fixative for single cell RNA sequencing

G3 (Bethesda, Md.); IF: 2.600; DOI: 10.1093/g3journal/jkad160

内容概要：该研究探讨了scRNA-seq中细胞固定的问题，提出了使用乙二醛作为细胞固定剂的方案。通过Drop-seq方法，在乙二醛固定的果蝇细胞和人类细胞中检测到了高水平的转录本和基因。同时，乙二醛固定的样本与未固定的样本之间的基因表达数据高度相关，表明该固定方案不会引起基因表达的显著变化，从而保留了转录组的完整性。因此，乙二醛是一种适合于果蝇和其他物种的细胞固定剂，可用于高质量的scRNA-seq应用。

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