以COVID-19Mpro为靶点的药用植物皂甙研究
来源 TMR Publishing Group
作者 Traditional Medicine Research 编辑部
研究发现
约34种皂甙对COVID-19Mpro比羟基氯喹、氯喹和奈非那韦更有效，其中，13种皂苷对COVID-19Mpro的结合能大于10kcal/mol。
背景
2019冠状病毒病(COVID-19)是一种呼吸道感染性疾病，首次在中国武汉发现，并通过传播至全球，急需治疗COVID-19的有效抗病毒药物。但是药物研发不能一蹴而就，奉为“人民的希望”的瑞德西韦曾是针对埃博拉病毒、研发了13年但最终无效的药物，关于其治疗新冠病毒的安全性、疗效的定论还遥遥无期。
2020年4月9日，Nature加速发表了中科院上海药物所、清华大学和上海科技大学的三位大牛蒋华良院士、饶子和院士和杨海涛研究员团队发现的治疗COVID-19的新靶点Mpro蛋白酶。
目前，草药中的许多成分被确定为冠状病毒病2019（COVID-19）Mpro的潜在抑制剂，其中，皂甙的主要优点是保护植物免受各种病原体的攻击。皂甙在增强对抗原的细胞介导和体液免疫应答方面起着关键作用，而且发现皂甙对RNA和DNA病毒都具有抗病毒活性。
在这项研究中，作者筛选了多种抗COVID-19Mpro的皂苷，利用分子对接技术筛选了抗COVID-19主要蛋白酶的皂苷库，并鉴定了基于植物的抗COVID-19药用皂苷的临床应用潜力。
方法
使用AutoDock tools 1.5.6、BIOVIA Discovery Studio 2017 R2、Chimera 1.13.1和AutoDock Vina，使用6LU7 Mpro分析草药基生物活性皂苷的文库，以评估它们对COVID-19 Mpro的效力。以常规西药羟氯喹、氯喹、奈非那韦为阳性对照进行比较。
结果
获得了60个皂苷与6lu7Mpro的结合能，其中34个皂苷对COVID-19Mpro比羟基氯喹、氯喹和奈非那韦更有效。13种皂苷对COVID-19Mpro的结合能均大于10kcal/mol，具有很高的抗COVID-19Mpro活性。
结论
需要进一步研究所有有效皂苷对COVID-19的抗药性。
表1 COVID-19的潜在药物主要蛋白酶抑制剂
图1 (A)羟氯喹、(B)氯喹、(C)奈非那韦与COVID-19主要蛋白酶活性位点(PDB: 6LU7)的分子对接
图2 COVID-19主要蛋白酶与皂苷结构的结合作用
表2 13种皂苷抗COVID-19主要蛋白酶10 kcal/mol的结合能和高相互作用
图3 6 LU7与几种皂苷分子对接分析
表3 27种皂苷抗COVID-19的结合能和相互作用
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引用格式
Rehan M, Shafiullah. Medicinal plant-based saponins targeting COVID-19 M pro in silico. Tradit Med Res. 2021;6(3):24. doi: 10.12032/TMR20201130210.
传统医学研究 Traditional Medicine Research（ISSN 2413-3973）已被Emerging Sources Citation Index (ESCI), 2020年中科院期刊分区, Embase, DOAJ, ProQuest, J-Gate, EuroPub, WHO-COVID-19 Database 等数据库收录。特别欢迎具有明确历史记载、民族特色和地域特色的传统医学研究和相关社会科学研究。官网：https://www.tmrjournals.com/tmr投稿地址：https://submission.tmrjournals.com/submission?journal=18
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