蛋白质的高通量鉴定的技术手段
蛋白质组学诞生至今衍生了许多不同的研究方法,如酵母双杂交系统、抗体芯片技术、凝胶电泳技术和表面离子共振技术等,这些方法在通量、灵敏度以及准确性等方面都差强人意,直到生物质谱技术的出现才让蛋白质组学研究迎来了高光时刻。生物质谱技术同时满足了高通量、高分辨率和高准确性的需求,已成为当前蛋白质组学研究的强有力工具。
基于质谱的技术通过“自下而上”分析策略可以尽可能多的鉴定复杂样品中的全部蛋白质,同时实现成百上千种蛋白质的鉴定,在高通量的基础上也保证了鉴定结果的准确性。基于高通量质谱的蛋白质鉴定方法大致流程为先将蛋白样品酶解消化为小分子肽段,再对经色谱技术分离的肽段进行质谱检测,扫描并采集所有肽段母离子的碎片信息,根据肽指纹图谱即肽段的质谱数据结合理论数据库软件以及生物信息学分析方法可以确定肽段的分子质量等信息,再通过肽段拼接实现完整蛋白质的鉴定,包括定性定量鉴定、结构鉴定和翻译后修饰情况鉴定等。