经直肠超声检测已广泛用于诊断母牛的生殖情况。子宫诊断包括早孕、多胎妊娠、胎儿公母、子宫腔内渗出物、早期胚胎死亡、动情周期阶段（动情与发情）以及其他异常情况。卵巢诊断包括卵泡动力学、发情周期的阶段（发情与绝情）、是否存在黄体、卵巢囊肿、对供体在发情和绝情时的超刺激反应、卵巢肿瘤、多囊卵巢和动情与绝情。

这里主要讲一下牛用B超机检测母牛胚胎是否死亡

母牛早期胚胎死亡 (EED) 期被定义为妊娠头三个月的部分，在此期间牛用B超机可以检测到母牛怀孕（育种后 25 至 95 天）。母牛的早期胚胎死亡发病率因营养、地方性传染病和其他原因等因素而异。在早期胚胎死亡的初始阶段，触诊不足以做出准确的诊断，而通过使用牛用B超机却可以检测出来。超声检测可早在第 30 天对胎儿的检查显示在早期胚胎死亡病例中心跳停止。在早期胚胎死亡的情况下，也可以通过超声检测到胎膜与子宫的分离以及漂浮在胎儿体液中的死组织的回声斑点。在早期胚胎死亡的晚期，胎儿图像失真，没有显示肢体运动（数字操作子宫时除外），即使胎儿液体量看起来正常，有时也看不见。

胚胎死亡的检测通常是在胎儿公母检测过程中进行的，或者当客户希望进行超声检查（而不是触诊）来对出售的母牛或小母牛进行妊娠试验时进行诊断。 通过牛用B超机检查胚胎死亡不仅可以节省金钱，还可以节省买家、卖家和兽医之间的潜在不良情绪，因为他们可能仅靠触诊就误诊怀孕了。一般牛场会在第 90 天通过牛用B超机检查对所有怀孕的受者进行常规检查，然后再将其释放给客户，最好在他的监督下进行。 在第 27 天（怀孕的初步检查）和第 90 天之间，常规胚胎移植明显减少了 6% 的胚胎死亡。