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原创 小果 生信果

最近有一个小伙伴私聊小果，说自己是做长非编码RNA的，问自己做完了处理前后的差异表达分析，得到了一群差异表达的基因，不知道下一步该怎么办了。不要慌，小果带着思路来啦！！！！！！！

最近长非编码RNA发展比较火热，对于长非编码RNA的研究也是花样百出，lncRNAs是指一类转录本长度超过 200nt，不具备蛋白编码能力的 RNA分子，目前已发现包括LncMyoD1、lncMREF等多个lncRNA通过分子海绵、蛋白互作、调控mRNA稳定性、调节mRNA翻译等多种机制参与机体的生命活动，并对机体生命活动产生重要作用。

我们知道，lncRNA发挥作用的形式，可以通过与调控因子互作，将调控因子拉到靶基因的启动子上，进而调控基因的表达，从而影响机体的生命活动（图一），我们可以通过处理前后的差异基因预测与lncRNA互作的蛋白，从而进行下一步的研究，而TRRUST数据库（https://www.grnpedia.org/trrust/Network_search_form.php）就可以实现咱们这个目的，快跟着小果来学习吧！！

图一（lvetal 2022）

1 进入数据库首页

https://www.grnpedia.org/trrust/Network_search_form.php

2 我们主要用到Find key regulators for query genes 这个功能

3 下一步将我们的处理前后的差异基因输入，并选择物种，点击提交就可以了

4 结果很快就出来了，结果也进行了排名，大家可以根据输出的结果，寻找和自己表型或者要解释的科学问题一致的基因进行后续的研究就可以了！

是不是超简单，赶快学起来，用起来吧，大家有疑问的地方欢迎大家和小果交流哟！！！

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