GE FANUC IS200VTURH2BAC 理解基因网络的结构和动态

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逆向工程概念已应用于生物同样，具体到理解的结构和功能的任务基因调控网络。它们调节生物行为的几乎每个方面，并允许细胞进行生理过程和对扰动的反应。因此，理解基因网络的结构和动态行为是系统生物学的最大挑战之一，在基础研究之外的一些应用中具有直接的实际影响。[37]使用分子生物学和数据科学方法对基因调控网络进行反向工程有几种方法。它们通常被分为六类:[38]

这六类基因网络推断方法，根据[38]

• 共表达方法基于这样的概念，即如果两个基因表现出相似的表达谱，它们可能是相关的，尽管不能简单地从共表达中推断出因果关系。

• 序列基序方法分析基因启动子以找到特定的转录因子 结合域。如果预测转录因子结合特定基因的启动子，可以假设存在调控联系。

• 染色质免疫沉淀(芯片)方法研究基因组-广泛的DNA结合来推断它们下游的基因网络。

• 矫正方法将基因网络知识从一个物种转移到另一个物种。

• 文献方法实施文本挖掘和人工研究来识别假定的或实验证明的基因网络连接。

• 转录复合物方法利用转录因子之间蛋白质相互作用的信息，从而扩展了基因网络的概念，包括转录调节复合物。

通常，基因网络的可靠性是通过遗传扰动实验，然后进行动态建模来测试的，其原理是移除一个网络节点会对网络中其余节点的功能产生可预测的影响。[39]基因网络逆向工程的应用范围从理解植物生理机制[40]突出抗癌治疗的新靶点