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铁死亡基因的专属仓库,FerrDb数据库

2022-12-26 13:53 作者:小云爱生信  | 我要投稿

尔云间  一个专门做科研的团队

原创 小果 生信果 

小果在查询基因集的时候经常会遇到各种数据库,而有一些热点的基因集其实是有他们专属的数据库的,比如说铁死亡,下面就有小果来介绍一下铁死亡基因的数据库吧。


这个数据库叫FerrDb,上链接

http://www.zhounan.org/ferrdb/current/

图片

看一下首页,先说一下最重要,如何让下载到铁死亡的数据集,就是点右上角的download。


图片

Data Set是选择要下载的数据类型,来了解一下吧:

  1. Driver是驱动基因,

  2. suppressor是抑制基因,

  3. Marker是标志基因,

  4. Unclassified是未归类的基因,

我们下载基因集一般就会选择这几种基因,后面选一个格式就可以点击download下载了。


说完了大家最想知道的,再来补充一点小知识吧:


铁死亡(Ferroptosis)是一种铁依赖性的调节性细胞死亡方式,与多种人类疾病(例如癌症、心血管疾病和退行性疾病等)紧密相关。铁死亡的过程很复杂,由多种代谢物和生物分子组成,也有一些特征基因发生变化。现如今铁死亡已成为除m6A、自噬、肠道微生物、肿瘤免疫等明星研究的又一大热点, FerrDb数据库可以助我们轻松入门铁死亡研究热点。


FerrDb数据库是由广州医科大学附属脑科医院、四川大学生命科学学院以及生物资源与生态环境教育部重点实验研究团队共同建成的, FerrDb是现如今第一个人工整理的铁死亡数据库,用于管理和鉴定铁死亡相关的标志物和调控因子以及铁死亡关联疾病的数据库 。FerrDb中的数据都可免费下载和使用。


好了,小伙伴们,这就是今天小果要介绍的主要内容了,有什么问题的话欢迎来和小果分享讨论哟。


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