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使用生物信息学分析确定在非洲锥虫病进展期间牛品种转录因子的特定伴侣选择

2021-01-15 19:10 作者:geneXplain  | 我要投稿

微信公众号: geneXplain

本期我们很高兴与您分享TRANSFAC®数据库在畜牧业中的应用实例。 在最近的出版物“使用生物信息学分析确定在非洲锥虫病进展期间牛品种转录因子的特定伴侣选择”中,对耐锥虫和对锥虫敏感的牛品种实验鉴定出了不同的协同转录因子。 这一发现说明了昼夜节律,免疫系统和脂质代谢调节剂之间的相互作用。 本实验的分析使用了TRANSFAC®,MATCH和PC-TraFF。

出版物的全文链接如下:

https://lnkd.in/gjVBjyM

图1.分析流程图。 (a)处理微阵列数据集; (b)使用MFSelector方法鉴定单调表达的基因; (c)启动子分析(TSS:转录起始位点); (d)使用PC-TraFF方法识别合作TF。


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