假设检验

• 定义

又称显著性测验，指根据总体或样本参数，提出假设(H0和HA，通常构成完全事件系)，在H0假设下，计算样本观测值发生的概率，从而做出判断。

• 常用方法

u检验、t检验、F检验和卡方检验。

• 基本理论依据

理论分布、小概率不可能性原理。

小概率不可能性原理：在一次试验中，概率很小的事件实际上是不可能发生的。（第一类错误 / 假阳性 α ；第二类错误 / 假阴性 β ）

• 步骤

① 根据总体和样本参数，提出无效假设

② 确定一个否定H0成立的概率 （α ） 

③ 计算H0在1-α下成立的接受域，或H0成 立的概率p 

④ 做出统计推断并对此加以解释

单样本t检验

推断该样本来自的总体平均数μ与已知的某一总体均数μ0（常为理论值或标准值）有无显著差别。

假设某水稻品种A千粒重为34g，现对另一新品种的千粒重进行100次测量，结果列于examp3-1.csv。

检验新品种的千粒重是否显著高于A？

多组数据t检验

假设某水稻品种A的千粒重为34g，现对另三个新品种的千粒重进行100次测量，结果列于example3-2.csv。

检验三个新品种的千粒重是否显著高于A 5%？另输出三个新品种的平均数、标准差、t统计数。

成对数据t检验

两组样本应一一对应，一对数据来源于实验条件基本一致的小区。

假设现要研究某肥料能否比原肥料每亩增产5kg以上皮棉，选各条件最近似的相邻小区组成一对，其中一区(x1)施新肥料，另一区施原肥料作对照(x2)，重复9次。产量结果见example3-3.csv。

检验新肥料能否比原肥料每亩增产10斤以上皮棉?

研究发现，基因的表达丰度主要受基因附近变异的顺式调 控。现有418个玉米品种，经RNA-seq获取了四个开花期基因 MADS69、ZCN8、myb74和Rap2.7的表达谱数据（ example3-4-2.csv），并检测了每个基因启动子区的一个核苷酸变异基因型（example3-4-1.csv）。

检验启动子区的该核苷酸突变是否会显著影响该基因本身的表达量？