每日科研进展l2022.08.06l利用RNA-Seq技术研究HvβCOPIdsRNA处理茄28星瓢虫后脱靶效应

RNA 干扰 (RNAi) 技术中使用的双链 RNA (dsRNA) 的特异性对于序列特异性基因沉默的成功至关重要。目前，RNAi介导的昆虫控制是害虫防治研究的一个趋势。然而，dsRNA 在 RNAi 中的脱靶效应是一个主要的制约因素。在这项研究中，比较了茄 28 星瓢虫的 dsHvβ'COPI处理和未处理的转录组，以了解其沉默效应带来的脱靶效应。 RNA-Seq 结果显示，与对照组相比，dsHvβ'COPI 处理组中分别有 63 和 44 个差异表达基因 (DEG) 上调和下调（图 1）。

通过逆转录定量 PCR (RT-qPCR) 分析验证了一些选定的 DEG 的差异表达，证实了转录组分析结果的可靠性。进一步的下游分析表明，在茄 28 星瓢虫中没有与 Hvβ'COPI 同源的基因。此外，在茄 28 星瓢虫转录组中没有发现与 dsHvβ'COPI 连续匹配 >11 bp 的基因。选择了可能参与茄 28 星瓢虫的各种代谢途径的6 个基因（Hvcitron、Hvhelicase、Hvtransposase、Hvserine、Hvdynein 和 HvE3 泛素）来检查 dsHvβ'COPI 的脱靶活性(图 2）。

通过使用 RNAi 评估沉默这六个脱靶基因的严重程度。RNAi 结果证实了这 6 个基因的表达均下调，但是没有显著的致死性（图 3）。本研究的结果将有助于未来 RNAi 介导的害虫防治实验的风险分析。

原文链接：

https://doi.org/10.1016/j.jia.2022.07.015