源码阅读网myBatis源码分析师(精剪版)

java -jar $picard BuildBamIndex \    INPUT=dedup_sample1.bam #查看@RG samtools view -H dedup_sample1.bam | grep '@RG'

如果同一样本（同一文库）多次上样测序，需要将多次测序结果合并后，再进行sort,mark。

#merge bam files(利用picard可以保留@RG; samtools合并时会丢掉@RG） time java -jar $picard MergeSamFiles\ I=1.bam I=2.bam\ O=12.bam