还为分子克隆阳性率低烦恼吗?无缝克隆了解一下~
做分子克隆的小伙伴想必都有这一经历:PCR、酶切、连接、转化,仔细检查每一个步骤,可最终筛选阳性克隆时结果依然不尽人意,也想不出究竟哪一步出了问题,导致实验十天半个月完全没有进展,而无缝克隆,一步法构建同源重组载体或许可以解决这一实验难题。
图1 分子克隆示意图
(a)传统克隆(b)无缝克隆
无缝克隆(Seamless Cloning/In-Fusion Cloning),与传统PCR产物克隆的差异在于载体末端和引物末端应具有15-20个同源碱基,由此得到的PCR产物两端便分别带上了15-20个与载体序列同源性的碱基,依靠碱基间作用力互补配对成环,无需酶连即可直接用于转化宿主菌,进入宿主菌中的线性质粒(环状)依靠自身酶将缺口修复。基于这个原理,汉恒生物开发出了HB-infusionTM 无缝克隆试剂盒。
图2 HB-infusionTM 无缝克隆试剂原理示意图
无缝克隆的优势
1. 相比传统克隆,操作简单,只需要一次反应即可完成定向克隆。
2. 对酶切位点无要求,可以把目的片段插入到载体的任意位点。
3. 连接片段之间不会引入其他序列。
4. 可以同时克隆多个片段。
无缝克隆操作步骤
1. 制备线性化载体
(1)质粒酶切法:在目标载体质粒上选取合适的位点进行单酶切或双酶切,对酶切后的载体进行割胶纯化
(2)质粒PCR法:在插入位点两侧设计一对方向相反的引物对载体进行扩增,通过跑胶回收获取线性化载体片段
2. 目的插入片段制备
设计引物进行目的片段PCR 扩增,引物设计要保证目的片段两端有15~25 bp 序列与线性化载体的两端一致(重叠序列的Tm≥48℃,可以按A-T 碱基对=2℃,G-C 碱基对=4℃大致估算)便于拼接反应的进行。
PCR 引物包括5’端与载体同源的15~25 bp 以及目的片段特异性序列20~25bp(见下图3)。PCR 产物经跑胶纯化待用。
图3 PCR上下游引物设计示例
3. 配制无缝克隆反应体系
上述反应体系置于50℃孵育20 min(2-3 个片段拼接)/60 min(4-6 个片段拼接)。反应完成之后若不能马上进行后续操作可将反应样品暂储存于-20℃。
4. 转化感受态大肠杆菌,次日挑取克隆进行PCR或酶切鉴定
以上就是本次的全部内容了,介绍了无缝克隆的原理、优势和实验操作,希望对做分子克隆的小伙伴有所帮助~
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