PCR区分|PCR qPCR RT-PCR bPCR 长距离PCR
PCR(聚合酶链反应)是一种用于扩增特定DNA片段的技术。根据应用和设计,PCR可以分为多种类型,下面是其中一些常见的PCR类型及其区别:
1.标准PCR(常规PCR):标准PCR是最常见的PCR类型,它使用DNA模板、引物(前向和反向引物)和DNA聚合酶来扩增目标DNA片段。PCR循环包括变性、退火和延伸步骤。
通常使用DNA模板浓度为10-100 ng,引物浓度为0.2-0.5 μM,反应体系总体积为20-50 μL,反应温度通常为94-98°C的变性,50-65°C的退火,以及72°C的延伸。反应周期数一般为25-35个。
2.实时定量PCR(qPCR):qPCR是一种可以实时监测PCR反应进程的技术。它使用荧光探针或DNA结合染料来定量PCR产物的数量。qPCR可以提供准确的DNA定量和相对表达水平。
实时定量PCR(qPCR):通常使用DNA模板浓度为1-100 ng,引物和荧光探针的浓度为0.1-0.3 μM,反应体系总体积为10-25 μL,反应温度通常为95°C的变性,50-65°C的退火,以及72°C的延伸。实时监测PCR信号的周期数(Ct值)可以定量PCR产物的数量。
3.逆转录PCR(RT-PCR):RT-PCR是一种用于从RNA模板合成DNA的技术。它结合了逆转录和PCR步骤,用于研究基因表达和RNA病毒的检测。
通常使用RNA模板浓度为10-1000 ng,逆转录酶的浓度为100-2000 U,引物浓度为0.2-0.5 μM,反应体系总体积为20-50 μL,逆转录温度通常为42-55°C,变性温度为94-98°C,退火温度为50-65°C,延伸温度为72°C。
4.数字PCR(dPCR):dPCR是一种用于精确测定DNA模板的绝对拷贝数的PCR技术。与qPCR不同,dPCR将PCR反应分成多个微小的反应区域,通过计数阳性和阴性反应来确定DNA的拷贝数。
通常使用DNA模板浓度为10-1000 ng,引物和探针的浓度为0.1-0.3 μM,反应体系总体积为10-25 μL,反应温度通常为95°C的变性,50-65°C的退火,以及72°C的延伸。通过分割PCR反应体系,计数阳性和阴性反应来确定DNA拷贝数。
5.长距离PCR:长距离PCR用于扩增较长的DNA片段,通常超过5 kb。它需要特殊的引物设计和优化的反应条件。